De nouvelles affirmations explosives sont apparues selon lesquelles la Chine a supprimé un ensemble de données contenant des séquences de covid du début de l’épidémie de Wuhan qui pourraient fournir des indices vitaux dans la recherche du « Patient zéro » qui a déclenché une pandémie mondiale. L’enquête scientifique suggère également que le virus circulait à Wuhan avant qu’il ne soit détecté sur les marchés humides locaux.
Cela suggère que les premiers virus covid étudiés par l’Organisation mondiale de la santé ne sont pas pleinement représentatifs des souches virales circulant au cours de ces premiers mois. Le virus a maintenant tué près de quatre millions de personnes.
Le professeur Jesse Bloom, professeur agrégé au Fred Hutch Cancer Research Center de Seattle, a publié mercredi la nouvelle recherche.
Il révèle qu’un ensemble de données contenant des séquences du SRAS-CoV-2 du début de l’épidémie de Wuhan a été supprimé des archives de lecture de séquences de l’Institut national de la santé.
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Le document de recherche, La récupération des données de séquençage profond supprimées met en lumière la première épidémie de SRAS-CoV-2 à Wuhan, avait identifié un ensemble de données contenant des séquences du SRAS-CoV-2 du début de l’épidémie de Wuhan qui a été supprimée des archives de lecture de séquence du NIH.
“Je récupère les fichiers supprimés du Google Cloud et reconstruis des séquences partielles de 13 virus épidémiques précoces”, écrit le professeur Boom dans le résumé du rapport.
Et il trouve qu’il n’y a aucune raison plausible pour les fichiers manquants qui ont été supprimés et l’explication la plus probable est que la Chine a supprimé le matériel pour “obscurcir leur existence”.
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« Le fait qu’un tel ensemble de données informatif ait été supprimé a des implications au-delà de celles directement glanées à partir des séquences récupérées. Les échantillons des premiers patients ambulatoires de Wuhan sont une mine d’or pour quiconque cherche à comprendre la propagation du virus », écrit-il.
« Même mon analyse des séquences partielles est révélatrice, et il aurait clairement été plus informatif scientifiquement de séquencer entièrement les échantillons plutôt que de supprimer subrepticement les séquences partielles. Il n’y a aucune raison scientifique plausible à la délétion : les séquences sont parfaitement concordantes avec les échantillons décrits dans Wang et al. Il semble donc probable que les séquences aient été supprimées pour masquer leur existence.
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Le virologue est un acteur majeur du débat sur les origines du covid et a cosigné en mai une lettre influente de scientifiques appelant à une plus grande enquête scientifique sur les origines du virus.
Ses recherches suggèrent que les séquences du marché des fruits de mer de Huanan qui font l’objet du rapport conjoint OMS-Chine ne sont pas pleinement représentatives des virus à Wuhan au début de l’épidémie.
Au lieu de cela, l’ancêtre des séquences connues du SRAS-CoV-2 contenait probablement trois mutations par rapport aux virus du marché qui le rendaient plus similaire aux parents du coronavirus de chauve-souris du SRAS-CoV-2.
« Comprendre la propagation du SRAS-CoV-2 à Wuhan est crucial pour retracer les origines du virus, y compris pour identifier les événements qui ont conduit à l’infection du patient zéro », écrit le professeur Bloom.
« Les premiers rapports hors de Chine fin décembre 2019 soulignaient le rôle du marché des fruits de mer de Huanan (ProMED 2019), initialement suggéré comme site de zoonose.
“Cependant, cette théorie est devenue de plus en plus ténue car on a appris que de nombreux cas précoces n’avaient aucun lien avec le marché.
“Finalement, le directeur chinois du CDC Gao Fu a rejeté la théorie, déclarant” Au début, nous avons supposé que le marché des fruits de mer pourrait avoir le virus, mais maintenant le marché ressemble plus à une victime. Le nouveau coronavirus existait bien avant ».
Le professeur Bloom note qu’il y a eu des rapports de cas qui ont précédé de loin l’épidémie au marché des fruits de mer de Huanan et que la revue médicale respectée The Lancet a décrit un cas confirmé n’ayant aucun lien avec le marché dont les symptômes ont commencé le 1er décembre 2019.
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Le South China Morning Post a également décrit neuf cas de novembre 2019, y compris des détails sur l’âge et le sexe du patient, notant qu’aucun n’a été confirmé comme étant « patient zéro »
Malgré cela, le rapport OMS-Chine a rejeté tous les cas signalés avant le 8 décembre comme n’étant pas COVID-19, et a ravivé la théorie selon laquelle le virus pourrait provenir du marché des fruits de mer de Huanan.
Le professeur Bloom a récupéré les fichiers supprimés du Google Cloud et reconstruit des séquences partielles de 13 premiers virus épidémiques.
Mais les données récupérées contiennent également un nouveau mystère. Les données virales récupérées par le professeur Bloom ne correspondaient pas à ce que le scientifique attendait.
« Maintenant, je dois donner des informations sur le contexte pour expliquer un mystère scientifique déroutant concernant d’autres premières séquences #SARSCoV2. Bien que les événements qui ont conduit à l’émergence du # SARSCoV2 à Wuhan ne soient pas clairs (zoonose vs accident de laboratoire), tout le monde s’accorde à dire que les ancêtres profonds sont des coronavirus de chauves-souris », a-t-il déclaré.
«Par conséquent, nous nous attendions à ce que les premières séquences #SARSCoV2 soient plus similaires aux coronavirus de chauve-souris, et à mesure que #SARSCoV2 continuerait d’évoluer, il deviendrait plus différent de ces ancêtres. Mais ce n’est pas le cas!
“Au lieu de cela, les premiers virus #SARSCoV2 du marché des fruits de mer de Huanan sont plus différents des coronavirus de chauve-souris que les virus #SARSCoV2 collectés plus tard en Chine et même dans d’autres pays.”
Le professeur Bloom écrit qu’il existe quelques scénarios qui peuvent expliquer ce résultat.
« Comment les séquences supprimées que j’ai récupérées sont-elles liées à cette énigme ? Si nous incluons ces séquences, et notez que les séquences 4 du Guangdong proviennent de deux groupes de personnes infectées à Wuhan fin décembre / début janvier, nous obtenons des scénarios plausibles qui résolvent les problèmes ci-dessus », a-t-il déclaré.
« Ces deux scénarios sont tracés ci-dessous. Chacun a un « progéniteur » différent, qui est la séquence qui a donné naissance à toutes les séquences #SARSCoV2 *actuellement* connues (il peut toujours ne pas s’agir du virus qui a infecté le patient zéro si d’autres séquences précoces restent inconnues).
« Les deux progéniteurs putatifs ont 3 mutations par rapport aux virus du marché des fruits de mer qui les rendent plus similaires au coronavirus de chauve-souris.
« Les deux progéniteurs suggèrent que #SARSCoV2 circulait à Wuhan avant l’épidémie de décembre au marché des fruits de mer de Huanan, ce qui est corroboré par de nombreuses autres preuves, y compris des articles de presse en provenance de Chine début 2020.
« Le partage de séquences pourrait être encore limité par le fait que les scientifiques en Chine sont soumis à une ordonnance du Conseil d’État exigeant l’approbation centrale de toutes les publications.
« La deuxième implication majeure est qu’il peut être possible d’obtenir des informations supplémentaires sur la propagation précoce du #SARSCoV2 à Wuhan même si les efforts pour davantage d’enquêtes sur le terrain sont entravés.
« La communication scientifique et le partage de données reposent généralement sur la confiance. L’archive de lecture de séquence NIH compte plus de 13 000 000 d’exécutions, ils doivent donc faire confiance aux auteurs lorsqu’ils demandent des suppressions car il n’est pas possible de valider les raisons de toutes les demandes, dont certaines sont légitimes.
Le professeur Bloom a également déclaré que ses recherches suggéraient que les scientifiques pourraient poursuivre leurs investigations indépendamment du fait que d’autres blessures “officielles” soient appelées.
«Il est important d’examiner si d’autres systèmes scientifiques fondés sur la confiance ont également pu être utilisés pour masquer des données relatives aux origines / à la propagation précoce de #SARSCoV2. Cela comprend non seulement un examen plus approfondi des bases de données de séquences, mais également des revues d’articles, des rapports sur les subventions, etc. », écrit-il.
« Il y a aussi des implications plus larges. Premièrement, le fait que cet ensemble de données ait été supprimé devrait nous rendre sceptiques quant au partage de toutes les autres premières séquences pertinentes de Wuhan. Nous savons déjà que de nombreux laboratoires en Chine ont ordonné de détruire les premiers échantillons :
« La troisième implication majeure est que les scientifiques doivent rester concentrés sur l’étude basée sur les données des origines / propagation précoce du #SARSCoV2. Après avoir passé les 4 derniers mois à étudier cela de près, je suis prudemment optimiste quant au fait que d’autres données pertinentes sont encore susceptibles d’être révélées.
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