La plupart des hypercholestérolémies familiales dépassent les tests génétiques

Selon une étude, la majorité des cas d’hypercholestérolémie familiale (FH) ne seraient pas détectés si les gens se fiaient uniquement à des tests génétiques basés sur des tableaux.

Par exemple, le test 23andMe – offrant un dépistage limité pour seulement 24 variantes connues de FH – aurait manqué plus de 60% des personnes atteintes du trouble autosomique dominant, a rapporté Amy Sturm, du Geisinger Genomic Medicine Institute à Danville, Pennsylvanie, et collègues.

Les tests Array avaient un taux d’omission de 68,9% pour les patients FH qui avaient des tests génétiques complets effectués pour une indication FH; le taux d’échec était de 61,8% pour ceux qui avaient subi un dépistage de santé proactif, ont-ils déclaré dans Cardiologie JAMA.

« Les écrans à variantes limitées peuvent faussement rassurer la majorité des personnes à risque de FH qu’elles ne portent pas de variante causant la maladie, en particulier les personnes d’ascendance noire / afro-américaine et hispanique autodéclarées », selon Sturm et ses collègues.

Dans leur étude, près de 94% et 85% des individus noirs et hispaniques avec des variants pathogènes FH confirmés auraient été manqués par le dépistage de variantes limitées. La même chose aurait été vraie pour un tiers seulement des Juifs ashkénazes.

« Le rendement réduit du dépistage à variantes limitées pourrait entraîner une disparité majeure des soins de santé pour les groupes déjà touchés par la privation des droits sociaux et médicaux qui engendrent de graves disparités en matière de santé, y compris un taux significativement plus élevé de décès cardiovasculaire chez les Noirs / Afro-américains », ont déclaré les enquêteurs. .

« Lorsque la FH est fortement suspectée sur le plan clinique, même si la notification de FH basée sur la matrice donne des résultats négatifs, un test génétique clinique doit toujours être envisagé », selon une note d’accompagnement Cardiologie JAMA rédacteurs en chef Pradeep Natarajan, MD, MMSc, ​​du Massachusetts General Hospital et de la Harvard Medical School à Boston, et Elizabeth McNally, MD, PhD, de la Northwestern University Feinberg School of Medicine à Chicago.

« Les bases de données génétiques surreprésentent les populations d’ascendance européenne et rendent donc l’interprétation de la variation génétique plus précise dans ces cohortes. Cependant, même 64% des mutations FH chez les individus américains européens auraient été manquées par la variante 24 [test]», ont observé Natarajan et McNally.

La FH prédispose les gens à des niveaux élevés de cholestérol LDL qui peuvent entraîner une coronaropathie prématurée et un décès prématuré.

« Malheureusement, les tests génétiques pour FH sont sous-utilisés, avec 90% des personnes touchées dans le monde restant non diagnostiquées et seulement 3,9% des patients atteints de FH aux États-Unis ayant un dossier de tests génétiques », ont noté Sturm et ses collègues.

« Des déclarations d’experts récentes recommandent que les patients soupçonnés d’avoir une FH se voient proposer des tests génétiques et que les parents au premier degré d’individus génétiquement positifs soient testés pour FH par profil lipidique ou test génétique », selon eux.

Des tests génétiques complets utilisent le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour détecter plus de 2 000 variants potentiellement pathogènes dans des séquences géniques complètes.

En revanche, 23andMe et d’autres écrans basés sur des tests testent uniquement un petit sous-ensemble de variantes connues et ne signalent pas si une personne a une ou deux copies d’une variante ou si des variantes de nombre de copies sont présentes.

Les deux types de tests génétiques pour FH sont disponibles en milieu clinique ou directement au consommateur.

« Que les tests soient obtenus directement par un consommateur ou dans un cadre clinique, les personnes testées devraient consulter un conseiller en génétique ou un autre professionnel de la santé qualifié pour comprendre pleinement les avantages et les limites des différents types de tests génétiques pour l’HF », a exhorté le groupe de Sturm. .

Pour l’étude, les auteurs ont pris des résultats NGS désidentifiés, provenant d’un seul laboratoire clinique, pour des panels de gènes d’individus soumis à des tests génétiques complets, soit pour une indication FH (n = 4563), soit comme dépistage de santé proactif (n = 6482).

Les deux cohortes ont été testées pour plus de 2000 variantes possibles dans quatre gènes associés à la FH: LDLR, APOB, PCSK9, et LDLRAP1.

Les personnes ayant une indication FH pour le test avaient un taux de détection positif de 27,0% avec un génotypage NGS complet. Le chiffre correspondant aurait été de 8,4% avec le test de dépistage limité.

Dans la cohorte proactive de personnes sans suspicion clinique de FH, la prévalence des variants de FH cliniquement significatifs était d’environ un sur 191 selon le test complet.

Les auteurs ont reconnu leur incapacité à confirmer les résultats des tests génétiques avec les antécédents médicaux et familiaux.

  • Nicole Lou est journaliste pour MedPage Today, où elle couvre l’actualité de la cardiologie et d’autres développements en médecine. Poursuivre

Divulgations

Sturm a révélé le soutien d’Invitae. Les co-auteurs ont révélé des relations pertinentes avec Invitae, 10x Genomics, Personalis, 23andMe.

Natarajan a révélé le soutien et / ou des relations pertinentes avec Amgen, Apple, Boston Scientific, AstraZeneca, Blackstone Life Sciences, Novartis, Genentech / Roche, Foresite Labs et Vertex.

McNally a divulgué le soutien et / ou des relations pertinentes avec les NIH, l’American Heart Association, Amgen, AstraZeneca, Avidity, 4D Molecular Therapeutics, Cytokinetics, Janssen, Pfizer, Tenaya et Invitae, ainsi qu’être fondateur d’Ikaika Therapeutics .

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