La vaccination seule ne contrecarrera pas l’augmentation des variantes résistantes : étude

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L’assouplissement des interventions non pharmaceutiques une fois que la vaccination de la population a atteint un point de basculement avant l’immunité collective peut augmenter la probabilité d’émergence d’une souche résistante que la sélection naturelle favorise alors, selon les nouvelles conclusions d’une étude de modélisation publiée en ligne le 30 juillet dans Rapports scientifiques.

Bien que la vaccination soit la meilleure stratégie pour contrôler la propagation virale, des changements dans notre comportement et notre état d’esprit seront de plus en plus nécessaires pour rester en avance sur les souches résistantes aux vaccins, selon les quatre auteurs du rapport.

« Nous nous sommes habitués à penser à la pandémie du point de vue de l’épidémiologie et avons conseillé de réduire la transmission, le nombre de personnes malades et le taux de mortalité. À mesure que la pandémie se propagera au fil des années, il y aura une nouvelle dimension à notre la réflexion, à la fois pour les décideurs politiques et le public. Et c’est la perspective évolutionniste », a déclaré le co-auteur Fyodor Kondrashov, PhD, biologiste évolutionniste à l’Institut des sciences et technologies (IST), Klosterneuburg, Autriche, lors d’un point de presse jeudi.

Le “changement de mentalité” à venir que prévoit Kondrashov devrait rassurer les gens sur le fait que le masquage et la distanciation sociale même après avoir été vacciné ne sont pas vains. “Cela diminue la possibilité qu’une souche résistante au vaccin circule. Nous n’essayons pas seulement d’empêcher la propagation, mais l’évolution de nouvelles variantes, qui sont si rares à ce stade que nous ne les avons pas encore identifiées”, il a dit.

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L’étude s’est concentrée sur l’évolution de manière générique, plutôt que sur des variantes spécifiques. “Nous avons pris le modèle classique utilisé pour étudier l’épidémiologie des pandémies, le SIR [susceptible, infected, recovered] modèle, et nous l’avons modifié pour étudier la dynamique des mutations rares associées à l’émergence d’une souche résistante au vaccin », a expliqué Simon A. Rella, auteur principal de l’étude et doctorant à l’IST, lors du briefing.

Les chercheurs ont simulé la probabilité qu’une souche résistante au vaccin émerge dans une population de 10 000 000 d’individus sur 3 ans, les vaccinations commençant après la première année. Pour huit scénarios, les taux d’infection, de guérison, de décès, de vaccination et de mutation et le pourcentage d’individus présentant des souches virales résistantes étaient des facteurs dans le modèle.

Le modèle a également simulé des vagues de transmission faible et élevée, similaires aux effets d’interventions à grande échelle telles que les blocages.

Trois facteurs

L’étude a montré qu’un trio de facteurs augmente la probabilité qu’une souche résistante au vaccin s’installe :

Ces facteurs, a déclaré Rello, sont évidents dans une certaine mesure. “Chaque individu infecté est comme un mini-bioréacteur, augmentant le risque d’apparition de mutations qui doteront le virus de la propriété d’éviter le système immunitaire amorcé par un vaccin”, a-t-il déclaré.

Pas aussi évident, a ajouté Rello, que lorsque la plupart des gens sont vaccinés, une souche résistante au vaccin a un avantage sur la souche d’origine et se propage plus rapidement.

Mais nous pouvons l’arrêter, a-t-il dit. “Notre modèle montre que si, au moment où une campagne de vaccination est sur le point de se terminer et que des interventions non pharmacologiques sont maintenues, alors il y a une chance d’éliminer complètement les mutations résistantes au vaccin de la population virale.”

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Dans les scénarios dans lesquels une souche résistante s’est établie, la résistance est apparue initialement après qu’environ 60 % de la population ait été vaccinée. Cela rend les interventions non pharmaceutiques telles que le masquage et la distanciation sociale d’une importance vitale. Un peu moins de 50% de la population américaine de plus de 12 ans a été entièrement vaccinée, selon les Centers for Disease Control and Prevention.

“Nos résultats suggèrent que les décideurs politiques et les individus devraient envisager de maintenir des interventions non pharmaceutiques et des comportements de réduction de la transmission tout au long de la période de vaccination”, concluent les enquêteurs.

Une “force puissante”

“Nous espérons pour le mieux, que la résistance au vaccin ne s’est pas développée, mais attention que l’évolution est une force très puissante, et le maintien de certaines précautions pendant la vaccination peut aider à contrôler cette évolution”, a déclaré Kondrashov.

Les enquêteurs comptent sur les épidémiologistes pour déterminer quelles mesures sont les plus efficaces.

“Il est nécessaire de vacciner autant de personnes que possible aussi rapidement et globalement que possible et de maintenir un certain niveau d’intervention non pharmaceutique pour garantir que les variantes rares aient une chance d’être supprimées au lieu de se propager”, a conclu Kondrashov.

Il est pessimiste car de nombreux pays ont encore des difficultés à accéder aux vaccins et l’efficacité des vaccins diminue légèrement avec le temps. Les auteurs avertissent que “l’émergence d’une souche partiellement ou totalement résistante au vaccin et son établissement éventuel semblent inévitables”.

Le pire des cas est familier aux biologistes des populations : des séries de « développement de vaccins rattrapant la course aux armements évolutionniste contre de nouvelles souches », écrivent les auteurs.

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Les limites de l’étude sont que certains paramètres du taux d’évolution des souches résistantes au vaccin ne sont pas connus, et lors de la création du modèle, il n’a pas été tenu compte des effets d’une augmentation des tests, d’une recherche rigoureuse des contacts, des taux de séquençage du génome viral et restrictions de voyage.

Au contraire, le modèle illustre les principes généraux par lesquels la résistance aux vaccins peut évoluer, a déclaré Kondrashov.

Représentant scientifique. Publié en ligne le 30 juillet 2021. Texte intégral

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