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Pourquoi les meilleurs virologues s’inquiètent pour Omicron

by Les Actualites

Pour le virologue Trevor Bedford, PhD, la semaine dernière a de nouveau ressemblé à janvier 2020.

Au début de la pandémie, alors que les premières données de modélisation sur la transmissibilité du nouveau coronavirus commençaient à arriver, “ce qui se passerait était assez clair”, a-t-il déclaré.

“Il était assez facile de réaliser avec ces chiffres que nous étions en fait maintenant sur la planète B, même si une grande partie du monde pensait encore que nous étions sur la planète A”, a ajouté Bedford, qui a été l’un des premiers experts à sonner l’alarme sur la propagation de la communauté. aux États-Unis « Quand nous sommes arrivés en mars 2020, il est devenu très évident que nous étions sur la planète B maintenant. »

Bedford a pris la parole lors d’un panel virtuel organisé par son employeur, Fred Hutch, un centre de recherche sur le cancer à Seattle. Lui et d’autres chercheurs ont été interviewés par le président et réalisateur de Fred Hutch, Thomas Lynch Jr., MD, ainsi que par le comédien Trevor Noah, animateur de “The Daily Show”. Bedford a fait ces remarques précédentes à Noah.

Bedford a également déclaré à Noah que les chercheurs en janvier 2020 n’étaient pas disposés à passer des appels malgré les preuves qui s’accumulaient devant eux.

“Cette phrase que je déteste est : ‘Il n’y a aucune preuve que…'”, a déclaré Bedford. “‘Il n’y a aucune preuve que la variante Alpha soit plus sévère’ ou ‘Il n’y a aucune preuve que les masques fonctionnent.’ Quand, vraiment, c’est que vous n’avez pas de preuves solides et solides où vous pouvez dire : « Oui, c’est certainement le cas. »

“Mais vous devriez, avec le mélange de preuves dont vous disposez, être capable de dire:” Oui, nous soupçonnons que les masques fonctionnent “ou” Nous soupçonnons que la variante Alpha est plus grave “”, a-t-il noté.

« Les gens ne sont pas prêts à prendre suffisamment de risques [when it comes to] ce qu’ils pensent réellement”, a-t-il ajouté.

Bedford a également décrit à Noah ce que c’était que d’être à l’avant-garde de la mise en place et de l’exécution des tests de coronavirus aux États-Unis, notant qu’en février 2020, son laboratoire avait des échantillons qui indiquaient la propagation de la communauté mais « on nous disait de ne pas les tester. “

“Nous l’avons fait quand même et avons découvert la transmission communautaire”, a-t-il poursuivi. “Par le séquençage du génome du virus, nous avons pu dire qu’il y avait environ 1 000 infections à ce stade plutôt qu’une seule.”

Alors pourquoi Bedford se soucie-t-il d’Omicron ? Il a dit à Lynch que le nombre de mutations dans la protéine de pointe est “un peu sauvage”.

D’autres variantes, y compris Alpha, Beta, Gamma et Delta ont eu “peut-être huit ou 10 mutations dans la protéine de pointe, et c’est en grande partie ce qui leur a donné leur phénotype avantageux. Omicron vient … peut-être d’un individu immunodéprimé, avec 30 mutations dans le protéine de pointe.”

“Dès que les gens ont pu voir ce génome, cela semblait frappant, cela semblait inquiétant”, a-t-il noté.

La propagation rapide dans la province sud-africaine du Gauteng est également un signal d’alarme, car elle remplace rapidement Delta, a-t-il déclaré.

“Si vous regardez le nombre de cas au fil du temps, vous obtenez peut-être trois fois le taux de propagation actuel de Delta”, a-t-il expliqué. “Delta [spread] était deux fois par rapport aux variantes précédentes.”

Pris ensemble, les changements dans le génome et l’augmentation rapide des cas “ont eu des gens très inquiets pour une bonne raison”.

Il faudra environ 2 semaines pour obtenir des informations plus claires sur l’évasion immunitaire d’Omicron via des tests de neutralisation, bien qu’il « semble déjà que ce sera différent », a-t-il déclaré.

Bedford a expliqué que les variantes Beta et Mu, par exemple, ont entraîné une baisse de huit à 10 fois des titres d’anticorps dans les tests de neutralisation testant l’immunité vaccinée – mais heureusement, cela n’a pas eu un impact important sur l’efficacité du vaccin.

“Ce que nous attendons, c’est de voir où en est Omicron”, a-t-il déclaré. “Est-ce 20 fois ? Est-ce 30 fois ? Nous savons que 20 fois est très différent de 50 fois. Il y a un très large éventail de chiffres que vous pouvez imaginer pour cette baisse.”

Il est également possible que le rappel ou la troisième dose des vaccins à ARNm offrent une protection décente contre Omicron, a-t-il noté.

“Nous savons qu’à partir de trois doses, vous obtenez un bel élargissement de la réponse immunitaire, donc cela pourrait être moins une baisse avec les trois doses, mais nous ne le savons pas encore”, a-t-il déclaré. “Nous pourrions avoir de la chance et trois doses protégeront toujours assez bien contre l’infection. Ou nous devrons peut-être essayer d’avoir très rapidement un rappel spécifique à Omicron et le faire passer par le processus réglementaire.”

Il est également possible, a-t-il ajouté, que trois doses ne confèrent pas de protection contre l’infection, mais préviennent une maladie grave.

Les thérapies par anticorps monoclonaux, en revanche, sont susceptibles d’être affectées, a déclaré Rachel Bender Ignacio, MD, MPH, un expert de Fred Hutch qui faisait également partie du panel. C’est parce qu’ils ciblent des régions où Omicron a connu des mutations, a-t-elle expliqué, et les variantes précédentes ont causé des problèmes similaires pour ces thérapies.

Mais les antiviraux à action directe comme le molnupiravir de Merck ou le ritonavir de Pfizer ne seront probablement pas affectés, a poursuivi Bender Ignacio. Ces deux cibles ciblent la réplication virale.

“Omicron a beaucoup de mutations dans la protéine de pointe, mais nous ne pensons vraiment pas que ces mutations auront un effet sur la façon dont le virus se reproduit une fois qu’il est à l’intérieur de la cellule”, a-t-elle déclaré.

C’est un signe d’espoir, car Bedford a lancé un appel ferme pour qu’il n’y ait jamais de monde “post-COVID”.

« Les gens doivent se rendre compte que ça va être là pour toujours », a-t-il déclaré. “Chaque année, tout comme nous avons la saison de la grippe, il y aura une saison COVID. Ce sera une chose à laquelle nous devrons faire face chaque année.”

“Nous travaillerons sur de meilleurs vaccins, sur une meilleure ventilation et sur des antiviraux”, a-t-il promis.

  • Kristina Fiore dirige l’équipe de reporting d’entreprise et d’investigation de MedPage. Elle est journaliste médicale depuis plus d’une décennie et son travail a été reconnu par Barlett & Steele, AHCJ, SABEW et d’autres. Envoyez des conseils d’histoire à [email protected] Suivre

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