Les scientifiques ont créé « le plus grand arbre généalogique du monde » qui relie environ 27 millions de personnes dans le monde – vivantes et décédées.
Développé à l’Université d’Oxford, le nouveau réseau généalogique révèle comment les individus à travers le monde sont liés les uns aux autres avec des “détails sans précédent”.
Prenant la forme d’une méthode scientifique, d’un document de recherche et d’une vidéo, il remonte efficacement dans le temps pour montrer où vivaient les populations humaines et quand.
Les tout premiers ancêtres, qui sont antérieurs à Homo sapiens, remontent dans le temps à un emplacement géographique qui se trouve dans le Soudan moderne, il y a probablement plus d’un million d’années.
Cette image visualise les lignées ancestrales humaines inférées dans le temps et dans l’espace. Chaque lignée représente une relation ancêtre-descendant dans notre « généalogie déduite des génomes modernes et anciens ». La largeur d’une ligne correspond au nombre de fois que la relation est observée, et les lignes sont colorées sur la base de l’âge estimé de l’ancêtre
Le projet a été publié aujourd’hui dans la revue Science par des chercheurs du Big Data Institute de l’Université d’Oxford.
“Nous avons essentiellement construit un immense arbre généalogique, une généalogie pour toute l’humanité qui modélise aussi exactement que possible l’histoire qui a généré toutes les variations génétiques que nous trouvons chez les humains aujourd’hui”, a déclaré le Dr Yan Wong, auteur de l’étude et généticien évolutionnaire.
«Cette généalogie nous permet de voir comment la séquence génétique de chaque personne est liée à l’autre, le long de tous les points du génome.
«Alors que les humains sont au centre de cette étude, la méthode est valable pour la plupart des êtres vivants; des orangs-outans aux bactéries. Cela pourrait être particulièrement bénéfique en génétique médicale, en séparant les véritables associations entre les régions génétiques et les maladies des fausses connexions découlant de notre histoire ancestrale commune.
Les deux dernières décennies ont vu des progrès extraordinaires dans la recherche génétique humaine, générant des données génomiques pour des centaines de milliers d’individus, y compris des milliers de personnes préhistoriques.
Cela soulève la possibilité de retracer les origines de la diversité génétique humaine pour produire une carte complète de la façon dont les individus à travers le monde sont liés les uns aux autres, selon l’équipe.
Histogrammes bidimensionnels montrant l’emplacement géographique des lignées ancestrales à six moments. 1 kya est l’abréviation d’il y a mille ans
Jusqu’à présent, les chercheurs avaient du mal à trouver un moyen de combiner des séquences de génomes provenant de nombreuses bases de données différentes et à développer des algorithmes pour gérer des données de cette taille.
Cependant, la nouvelle méthode peut facilement combiner des données provenant de plusieurs sources et s’adapter à des millions de séquences génomiques.
L’étude a intégré des données sur les génomes humains modernes et anciens provenant de huit bases de données différentes et comprenait un total de 3 609 séquences génomiques individuelles de 215 populations.
Les génomes anciens comprenaient des échantillons trouvés à travers le monde avec des âges allant de 1 000 à plus de 100 000 ans.
«Essentiellement, nous reconstruisons les génomes de nos ancêtres et les utilisons pour former un vaste réseau de relations», a déclaré l’auteur principal, le Dr Anthony Wilder Wohns, aujourd’hui chercheur postdoctoral au Broad Institute du MIT et à Harvard.
«Nous pouvons alors estimer quand et où ces ancêtres ont vécu. La puissance de notre approche est qu’elle fait très peu d’hypothèses sur les données sous-jacentes et peut également inclure des échantillons d’ADN modernes et anciens.
Il y a environ 2 000 ans, les humains étaient bien répartis dans le monde entier, à l’exception d’une grande partie de l’Amérique du Nord, de l’Océanie et d’autres endroits.
Mais il y a plus de 300 000 ans, les humains étaient plus centrés en Afrique, montre l’animation
Les algorithmes ont prédit où les ancêtres communs doivent être présents dans les arbres évolutifs pour expliquer les schémas de variation génétique. Le réseau résultant contenait près de 27 millions d’ancêtres.
Après avoir ajouté des données de localisation sur ces échantillons de génomes, les auteurs ont utilisé le réseau pour estimer où les ancêtres communs prédits avaient vécu.
Les résultats ont capturé avec succès des événements clés de l’histoire de l’évolution humaine, y compris la migration hors d’Afrique.
Les tout premiers ancêtres identifiés par l’équipe étaient «très probablement» Homo erectus, une espèce éteinte d’humain archaïque, qui remonte dans le temps à un emplacement géographique qui se trouve dans le Soudan moderne.
Le Dr Yan Wong et le Dr Wohns ont déclaré dans une déclaration commune: “Ces ancêtres ont vécu jusqu’à il y a plus d’un million d’années – ce qui est beaucoup plus ancien que les estimations actuelles de l’âge des humains modernes (il y a environ 250 000 à 300 000 ans) – donc des morceaux notre génome a été hérité d’individus que nous ne reconnaîtrions pas comme des humains modernes, mais qui vivaient très probablement dans le nord-est de l’Afrique.
« Il est très probable que ces ancêtres très anciens étaient des Homo erectus, mais nous ne pouvons être sûrs de leur identité ou de leur localisation sans un ADN extrêmement ancien.
“Une conclusion importante de notre travail est que les personnes que nous qualifions souvent de “berceau de l’humanité” avaient elles-mêmes des ancêtres plus lointains dans le temps, dont les descendants sont encore parmi nous aujourd’hui.”
