Remerciements
Nous remercions P. Anklesaria, N. Russell et E. Emini pour les discussions et la planification des essais ; et L. Stamatatos, B. Correia, M. Azoitei, J. Bohl, S. Deeks et P. Fast pour leurs commentaires sur le manuscrit. Chez IAVI, nous remercions H. Park, L. Sunner, I. Ayanru, H. Bester, P. Neuenschwander, D. Todd, K. Rutkowski, R. Edelstein et K. Crisafi pour la gestion clinique ; J. Ackland pour avoir supervisé l’étude toxicologique; S. Hingorani, A. Elnatan et D. Zachariah pour les dépôts réglementaires ; et V. Tsvetnitsky, E. Sayeed, V. Sharma, J. Ackland, K. Syvertsen, S. Pallerla, S. Avula, P. Kishineskaya, R. Platt, N. Williams, R. Colacot et T. Hassell pour contrôle de fabrication et assurance qualité. Nous remercions O. Fagbayi et A. Mosley pour la gestion de projet au IAVI Neutralizing Antibody Center (NAC) à Scripps. Au Fred Hutchinson Cancer Center (FHCC), nous remercions D. Berger, G. Braun et K. Louis pour les opérations cliniques ; A. Varni, T. Haight, C. Marty et S. Ameny pour la gestion des échantillons et des analyses ; A. Heit pour le développement de la méthode FNA ; et M. Shen et J. Hural pour les opérations de laboratoire. À l’Université George Washington (GWU), nous remercions E. Malkin, S. Henn, A. Desrosiers et S. Walker pour les opérations cliniques ; et L. Scholte, L. Schellhaas et L. Hoeweler pour la gestion des échantillons et des tests. En ce qui concerne les tests BAMA chez Duke, nous remercions T. McNair, J. Choi et M. Archibald pour leur expertise technique ; S. Sawant pour l’analyse des données ; M. Sampson et A. Sharak pour la gestion des données ; J. Lucas pour l’environnement de laboratoire conforme aux bonnes pratiques de laboratoire clinique (GCLP) ; et M. Sarzotti-Kelsoe pour la supervision de l’assurance qualité. Pour les essais de neutralisation à Duke, nous remercions E. Domin, C. West et J. Chen. Au National Institutes of Health (NIH) Vaccine Research Center (VRC), nous remercions JM Brenchley pour son soutien à la cytométrie en flux, et M. Prabhakaran et B. Flach pour leurs conseils techniques. Chez IAVI et Scripps, nous remercions D. Sok, B. Briney, P. Skog, D. Nemazee et D. Burton pour un test préclinique in vivo du vaccin et de l’adjuvant. Chez GlaxoSmithKline Biologicals (GSK), nous remercions M. Koutsoukos, F. Roman, O. van der Meeren, C. Lorin et C. Laugier pour avoir fourni AS01B et pour la réalisation d’études précliniques de compatibilité et de toxicité. Nous remercions également C. Havenar-Daughton et B. Shakoor pour les séquences d’anticorps CLK, JH Lee pour avoir fourni des séquences BCR naïves humaines de (44), X. Wang et F. Batista pour avoir fourni des données de (49).
Financement: Ce travail a été soutenu par la Bill and Melinda Gates Foundation Collaboration for AIDS Vaccine Discovery (CAVIMC INV-007368 à DM et GDT ; CCVIMC INV-007371 à RAK, ABM et MJM ; VISC INV-008017 et INV-032929 à ACd ; VxPDC INV-008352 et INV-007375 à IAVI ; et NAC INV-007522 et INV-008813 à WRS ); IAVI (y compris IAVI 167627819 à MJM, accord de collaboration de recherche IAVI A08031 avec Karolinska Intitutet à GBKH, et autre soutien à WRS); le Centre d’anticorps neutralisants IAVI (NAC) au WRS ; National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) P01 AI094419 (HIVRAD Optimizing HIV immunogen-BCR interactions for vaccin development ») (au WRS) ; UM1 Al100663 (Scripps Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology and Immunogen Discovery) et UM1 AI144462 (Scripps Consortium for HIV/AIDS Vaccine Development) (à WRS et MJM); et UM1AI069481 (Seattle-Lausanne CTU), U19AI128914 (HIPC) et UM1AI068618 (HVTN LC) à MJM Ce travail a également été soutenu par le Conseil suédois de la recherche (subvention 2017-00968 à GBKH) et par le Ragon Institute of MGH, MIT, et Harvard (au WRS).
Les contributions de l’auteur: KWC, ACd, SM, DSL, JRW, WJF, MJM, ABM et WRS ont conçu l’étude. DJL, KWC, MJM, RAK et ABM ont supervisé le tri, la PCR et le séquençage des lymphocytes B. JRW, WJF, ACd, SM, GF et WRS ont effectué l’organisation des données et l’analyse de la séquence BCR. LB-F., A.Sr., JRP, REW, A.Se., J.Br., AMR, WH et DRA ont effectué ou assisté le tri des cellules B et/ou la PCR. SM, FR, A.Lo. et DSL ont assuré la planification des essais. VP et DSL ont surveillé la sécurité et le respect du protocole. NLY, LDW et GDT ont supervisé les études BAMA. Essais de neutralisation supervisés par KG, HG et DM. MMC et GBKH ont fourni une analyse du génotype VH1-2. KWC, LB-F., AC et ABM ont développé le pré-essai du test des cellules B. Organisation des données assistée par AT et DMB. MR a contribué à la conception de la porte. SC a fourni des conseils sur les FNA et les FACS. JM, O.Ko., NK, J.Be., DD et MJM ont supervisé toutes les activités cliniques. O.Ka. et A.Li. effectué une analyse SPR. CAC, T.Sc., XH et WRS ont planifié des études SPR et analysé les résultats. RT, EG, SE, NA, DL, T.-MM, MK et BG ont produit des protéines et des anticorps pour la SPR. WJF, CRM et ACd ont effectué des analyses statistiques. WRS a écrit le texte principal; DJL, KWC, JRW, CAC, O.Ka. et WRS ont rédigé les documents supplémentaires ; et tous les auteurs ont commenté. JRW, WJF, ACd, T.Si., KWC, DJL et WRS ont créé des figures et des tableaux.
Intérêts concurrents : WRS et SM sont les inventeurs des brevets déposés par Scripps et IAVI sur le monomère eOD-GT8 et les immunogènes 60mer.
Disponibilité des données et des matériaux : Toutes les séquences BCR et les fichiers d’analyse FACS produits dans cette étude sont disponibles dans le référentiel de données public https://github.com/SchiefLab/G001 (99). Le référentiel contient quatre modules distincts : (i) analyse FACS, (ii) analyse de la séquence BCR, (iii) analyse combinée de la fréquence des cellules B et du séquençage BCR, et (iv) génération de figures et de tableaux. Les instructions pour exécuter chaque module du référentiel sont fournies dans le fichier README. Les séquences des vecteurs d’expression d’anticorps ont été déposées dans GenBank sous les numéros d’accès ON512569, ON5125670 et ON5125671. Toutes les autres données sont disponibles dans le texte principal ou dans des documents supplémentaires.
