Suivi des microbes résistants aux antimicrobiens de gouttière à intestin

Des maux de gorge aux fièvres et aux infections potentiellement mortelles, la plupart des gens ont utilisé périodiquement des antibiotiques. Des rapports récents montrent que la pandémie mondiale de COVID-19 a augmenté l’utilisation d’antibiotiques.

Certains microbes peuvent être naturellement résistants à certains antimicrobiens. Dans d’autres cas, une mauvaise utilisation des antimicrobiens favorise la modification des gènes microbiens (les gènes sont des unités d’ADN), rendant les microbes résistants aux antimicrobiens. L’homme derrière la découverte des antibiotiques, Alexander Fleming, a donné un avertissement anticipé sur ce sujet dans sa conférence Nobel de 1945 : “M. X. a mal à la gorge. Il achète de la pénicilline et s’en donne, pas assez pour tuer les streptocoques (bactéries connues pour causer des maux de gorge et des amygdales) mais assez pour les éduquer à résister à la pénicilline. Il infecte alors sa femme. Mme X attrape une pneumonie et est traitée à la pénicilline. Comme les streptocoques sont maintenant résistants à la pénicilline, le traitement échoue. Mme X décède. Qui est principalement responsable de la mort de Mme X ?

Cette situation est appelée résistance aux antimicrobiens et les gènes qui confèrent la résistance sont appelés gènes de résistance aux antimicrobiens (ARG).

Gènes de résistance aux antimicrobiens

À l’échelle mondiale, les problèmes de santé dus à la résistance aux antimicrobiens ont augmenté. L’une des principales raisons est la mobilité des ARG. Les gènes de résistance peuvent être transférés d’une génération de microbes à la suivante par reproduction, et peuvent également être transférés par transfert horizontal de gènes (transfert non sexuel de matériel génétique entre différents microbes).

Cela implique que, quelle que soit leur origine, les gènes de résistance aux antimicrobiens peuvent être transmis de sources environnementales à l’intestin humain, et vice-versa.

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En tant qu’ingénieurs en environnement, nos recherches à l’Université McGill se concentrent sur le développement d’outils pour surveiller le mouvement des gènes de résistance aux antimicrobiens dans les eaux usées et sur la compréhension de l’impact du transfert d’ARG sur les microbes intestinaux humains. Outre la transmission de personne à personne de microbes résistants décrite par Fleming, il existe plusieurs autres voies par lesquelles ces microbes peuvent pénétrer dans le corps humain.

Eaux usées

Les eaux usées sont un puits pour les activités humaines et contiennent des gènes de résistance provenant des excréments humains, des fermes, des ménages et des hôpitaux. Les eaux usées traitées sont souvent rejetées dans les eaux de surface telles que les rivières, qui sont utilisées pour des activités récréatives telles que les sports, la pêche et la natation. Une étude transversale a révélé que l’intestin des surfeurs est trois à quatre fois plus susceptible d’être colonisé par des microbes multirésistants que l’intestin des non-surfeurs.

De plus, l’eau potable est obtenue à partir d’eaux de surface ou souterraines traitées. La recherche a montré que les biofilms de l’eau potable (agrégation de microbes vivant sur les surfaces) peuvent transférer des gènes de résistance aux antimicrobiens dans l’intestin de la souris, indiquant qu’ils pourraient également être transférés dans l’intestin humain.

Aliments

Pour augmenter la productivité animale, les antimicrobiens sont souvent appliqués dans les fermes, ce qui peut conduire à la sélection et au développement de gènes de résistance. L’épandage de fumier animal et de boues (sous-produit du traitement des eaux usées) dans l’agriculture peut favoriser le transfert de gènes de résistance aux antimicrobiens aux cultures vivrières. Il a été constaté que plusieurs ARG se déplacent du sol vers les parties comestibles des plantes telles que les tomates, la laitue et les fèves.

Air

Les gènes de résistance aux antimicrobiens inhalables constituent une menace silencieuse croissante pour la santé. Des rapports récents d’échantillons hospitaliers ont révélé que l’exposition humaine quotidienne aux bactéries résistantes contenues dans les aérosols est 10 fois supérieure à celles présentes dans l’eau potable.

Établissements de santé

Les établissements de soins de santé sont l’un des endroits les plus importants pour acquérir des infections multirésistantes en raison de la présence d’agents pathogènes opportunistes qui infectent les patients immunologiquement compromis. La présence d’antimicrobiens aide davantage au développement et à la sélection de microbes résistants, qui peuvent ensuite être transférés d’un patient à d’autres par contact interpersonnel ou via des surfaces communes telles que des poignées de porte, des barrières de lit ou des casiers.

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Voyager

Les voyageurs internationaux qui se sont rendus dans les pays en développement ont contracté des bactéries multirésistantes. Ils peuvent avoir acquis ces microbes via des aliments et de l’eau contaminés, en raison de mauvaises pratiques d’hygiène ou en raison de politiques d’utilisation différentielles des antimicrobiens d’un pays à l’autre.

Une approche One Health

Il est évident que des microbes résistants aux antimicrobiens nous entourent et il est normal de se sentir concerné. Mais ce qui est encore plus important à reconnaître, ce sont les petites étapes que nous pouvons tous encore adopter. Cela implique de s’assurer que les patients sont traités avec l’antibiotique approprié à la bonne dose.

Au niveau mondial, comprendre les voies de transmission des microbes résistants fait partie d’une approche One Health. Le concept holistique de One Health reconnaît que la santé des humains est interconnectée à la santé des animaux et de notre environnement. Cela permet de rassembler les ressources et les politiques pour surveiller et lutter contre la résistance aux antimicrobiens.

En effet, les microbes résistants courent un marathon avec les antimicrobiens, et nous devons prendre des mesures pour ralentir leur rythme. À long terme, cela garantirait que les antimicrobiens continueraient à soutenir la survie humaine.

(La conversation)