– AVIS –
Le 24 juillet 2024, John a testé positif pour Listeriatandis que dans l’USI. L’échantillon de John a été génétiquement lié, par le séquençage du génome entier, à un groupe de Listeria associé aux pommes de terre du Mexique.
Voici les enquêtes antérieures des États, FDA et CDC:
https://www.foodsafetynews.com/files/2025/08/2025-3195-cara-656-_redacted-4.pdf
https://www.foodsafetynews.com/files/2025/08/2025-3195-cara-775-_redacted-1.pdf
https://www.foodsafetynews.com/files/2025/08/2025-3195-cara-918-_redacted-1.pdf
Figure: SNP-are des séquences de la souche de représentants téléchargés dans le référentiel de séquences publics à
NCBI en juillet 2025
Le 16 juillet 2024, John a été admis à l’hôpital avec un mal de tête, une tombe du visage, des étourdissements et une IRM anormale. Sa famille craignait d’avoir un anévrisme.
Une semaine plus tard, le 22 juillet 2024, John a été intubé et sous sédation en USI, où il est resté pendant cinq semaines, se battant pour sa vie contre la méningite bactérienne causée par Listeria.
Lorsque John a été admis pour la première fois aux soins intensifs, il avait été hospitalisé pendant une semaine avec des symptômes; Il a fallu encore trois jours de test pour déterminer que Listeria était la cause de sa maladie. John était sur un ventilateur et plusieurs gouttes IV pour le garder en vie en USI. Il était comateux et ne répond pas pendant au moins une semaine. À un moment donné, il était tellement gonflé de liquides et de médicaments, il ne pouvait même pas fermer les yeux.
Après environ cinq semaines à l’USI, John a été transféré dans un hôpital de réadaptation pour les soins aigus à long terme (LTAC). Il a été peu sensible à sa famille pendant les premiers mois en LTAC. Il est resté incapable de bouger, de parler, d’avaler ou de voir sans double vision. Il a développé des blessures sous pression qui nécessitaient des soins graves, y compris un lit spécialisé. Il est resté sur la goutte d’antibiotique IV pendant 12 semaines, jusqu’à ce que le sang testé détermine que les bactéries avaient été tuées; Cependant, les effets massifs de l’infection comprenaient plusieurs abcès dans son tronc cérébral et son cervelet, et son cerveau a été enflé et enflammé.
John est resté sur le ventilateur jusqu’à la fin de novembre 2024. Il n’a pu s’asseoir que dans un fauteuil roulant, soutenu avec des oreillers pendant 30 minutes à la fois. John a commencé à recevoir du PT, de l’OT et de l’orthophonie. Pendant ce temps, John a rencontré plusieurs infections, notamment les infections urinaires, la bronchite et le pinkeye.
John a passé huit mois à l’hôpital de réadaptation et a continué à s’améliorer très lentement et à retrouver une certaine force. Mais les dégâts étaient évidents, comme le détaille sa femme:
Il a fait des gains en communication, mais il est devenu évident que sa perception cognitive et sa personnalité ont été affectées par les dommages de l’infection à Listeria. Il est dévastateur de voir que votre proche souffrir tellement et dévastateur à un tout autre niveau pour essayer d’aider et de le faire hallucinant que vous êtes quelqu’un d’autre et là pour leur faire du mal. Voir mon mari, mon partenaire dans la vie, avoir chaque partie de son corps et de son esprit affecté est quelque chose que je ne mettrai jamais ou non.
En mars 2025, John a été transféré en soins infirmiers qualifiés, mais il est rapidement devenu évident que ce n’était pas le niveau de soins approprié pour lui. En trois semaines dans l’établissement, EMS a été appelé à John à trois reprises; Deux fois, il avait sorti son propre tube Trach parce qu’il était devenu obstrué par des sécrétions et qu’il ne pouvait pas respirer, et une fois parce qu’il était tombé et aucune des infirmières ne pouvait le soulever. La santé mentale de John s’est également détériorée, avec lui disant qu’il se sentait négligé et comme s’il était laissé là pour mourir. Par la suite, en raison d’un manque de soins infirmiers, John s’est retrouvé en USI avec une pneumonie, où il est resté pendant 10 jours et, une fois de plus, a failli mourir. Il a été renvoyé à l’hôpital de réadaptation, pour recommencer le cycle – LTAC, la réadaptation, puis l’assurance le poussant à la porte aux soins infirmiers qualifiés. Sa femme écrit:
Je m’inquiète et recherche constamment où John peut être placé et le niveau de soins que je peux obtenir pour lui. Il a besoin d’aide pour marcher, se baigner, s’habiller ou prendre soin de lui. Il est sur un tube d’alimentation parce qu’il ne peut pas avaler sans aspirer. Il a une trachéotomie qui peut être permanente ainsi que le tube d’alimentation. Il peut parler mais est très difficile à comprendre au départ, car la moitié de son visage reste paralysé. Il ne peut pas écrire en raison de la perte de motricité fine, et il ne peut lire qu’avec des difficultés en raison d’une double vision. Il a récemment été diagnostiqué avec un syndrome affectif cognitif cérébelleux, pour lequel il n’y a pas de traitement et pas de guérison. La mémoire à long terme de John reste intacte, mais sa mémoire à court terme, sa régulation émotionnelle et son contrôle des impulsions sont tous affectés.
John n’est jamais rentré chez lui depuis qu’il a été admis aux soins hospitaliers en juillet dernier. Il peut ne jamais rentrer chez lui, car ses besoins médicaux, à la fois physiques et mentaux, restent complexes. John est un homme bien-aimé, réussi, dynamique, sain, intelligent et d’opinion qui a dirigé une famille et une entreprise. John est le directeur de création, PDG et membre fondateur de notre entreprise. En venant aux changements dans notre structure d’entreprise et en nous assurant que nous fournissons toujours les mêmes niveaux de réflexion et d’exécution a été un travail presque à temps plein, au-delà de la gestion de la garde de John. Heureusement, le leadership réfléchi de John avant sa disparition soudaine nous a donné un plan efficace pour continuer et maintenir notre niveau de performance, mais dire que cette fois a été stressant est franchement le euphémisme de l’année. Je ne dors que parce que je suis trop épuisé mentalement pour rester éveillé à un certain point.
Essentiellement, toute notre vie a été dominée et complètement bouleversée par la maladie de John depuis qu’il a été admis. J’ai eu du mal à être parent de notre fils de 15 ans tandis que mes heures (littéralement et mentalement) sont dominées par la gestion des soins de John. Je m’inquiète pour la santé mentale de mon fils tout en essayant de maintenir le mien et d’être une maman engagée et impliquée.
La version du mari, du père, du frère, de l’ami, de l’oncle et du patron que nous connaissions tous, aimons et dépendons est parti. Une version fantôme de John reste en place, et en raison de la complexité de ses besoins médicaux, nous ne savons pas pendant combien de temps. Il a été intéressant de le voir souffrir pendant une meilleure partie de l’année maintenant. Il a dit qu’il souhaitait être décédé en juillet dernier. Que dit-on à cela? À l’époque, j’étais tellement reconnaissant que John ait vécu… mais en voyant à quel point il est misérable maintenant, je ne me sens pas du tout reconnaissant. Je sens que mon meilleur ami et mari John est mort alors, et je suis veuve d’une personne vivante… et c’est un endroit vraiment horrible pour nous deux.
Près d’un an plus tard, nous recherchons toujours le lien concluant entre le dévastateur de John Listeria Maladie et toutes les autres malades et probablement les pommes de terre mexicaines. Question? Où est notre FDA et CDC et l’État du Texas dans l’enquête?
Le séquençage du génome entier (WGS), qui détermine la séquence nucléotidique complète de la composition génétique d’une bactérie, est désormais l’étalon-or pour la surveillance en laboratoire et l’étude des épidémies des infections d’origine alimentaire.
Avec WGS, les épidémies sont détectées plus rapidement lorsqu’elles sont plus petites et plus d’épidémies sont résolues et contrôlées que jamais. WGS a une résolution élevée inégalée en détectant des changements au niveau des pierres de construction du code génétique des bactéries. La résolution est si élevée que de petites différences pourraient être observées dans une seule déformation bactérienne et donc une souche par WGS n’est pas définie par une séquence mais plutôt par un groupe de séquences très similaires, par exemple les unes des autres, jusqu’à 10 différences. Biologiquement, les bactéries avec des séquences similaires partagent probablement un ancêtre commun récent. Dans le même sens, c’est une hypothèse de base dans la surveillance des épidémies que les bactéries avec des séquences très similaires proviennent probablement de la même source, même si elles sont collectées sur des périodes prolongées.
Très peu de temps après l’introduction de WGS dans la surveillance, les spécialistes de la sécurité alimentaire ont réalisé que les épidémies avec très peu de cas pourraient se produire sur de longues périodes, parfois des années. Le terme «bas et lent» a été introduit pour décrire ces épidémies. Cependant, même maintenant, les autorités de sécurité alimentaire recherchent rarement activement ces épidémies. Ils les étudient lorsqu’ils trébuchent accidentellement lorsqu’ils sont des isolats d’un aliment ou de l’environnement alimentaire qui correspondent aux isolats des patients historiques, ou des isolats de patients dans les enquêtes en cours d’épidémie correspondent aux cas apparemment sporadiques d’il y a des années. Un exemple de ce dernier est l’épidémie de Listeria liée à la crème glacée Blue Bell en 2015.
Il est bien connu que les souches bactériennes peuvent persister pendant des années dans les systèmes de production alimentaire et qu’une telle contamination a provoqué des épidémies. Par exemple, une souche particulière de Salmonella enteritidis a provoqué deux épidémies associées aux amandes de Californie dans les années 1990, ce qui a conduit à la mise en œuvre de la fumigation obligatoire des amandes pour la consommation humaine. Une souche de Salmonella Newport a provoqué des épidémies chaque année dans les années 2000 associées aux tomates produites dans la région de Delmarva. Un exemple plus récent est une souche d’E. Coli productrice de toxines Shiga provoquant plusieurs épidémies associées aux produits cultivés dans le sud de l’ouest des États-Unis. Les scientifiques des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont trouvé un nom, des souches de répétitions (à court de répétitions, d’émergences ou de persistance) pour de telles souches. Les souches de répétitions peuvent provoquer des épidémies avec différents véhicules alimentaires si la source ultime est en dehors des systèmes de production alimentaire (par exemple, ces dernières épidémies d’E. Coli) ou avec un seul véhicule si un système de production spécifique a été contaminé (par exemple les épidémies de Salmonella).
Après la mise en œuvre de WGS, il a été réalisé que certaines souches de représentants peuvent provoquer des épidémies «faibles et lentes» qui ne sont ni détectées ni étudiées parce que les signaux d’épidémie sont faibles et que les maladies sont trop étalées à temps pour être capturées par les algorithmes de détection utilisés par les autorités de santé publique. C’est dommage, car un problème de déformation des représentants qui semble petit dans un délai d’un an peut être un problème important et important de santé publique qui doit être résolu si elle persiste pendant des années. La richesse des données de séquence dans le réseau Genometrakr dans le référentiel de séquences publiques, SRA, au National Center for Biotechnology Information (NCBI) pourrait facilement être utilisée pour détecter de si grandes épidémies «faibles et lentes».
Récemment, les scientifiques ont découvert un représentant des représentants dans la SRA, lorsqu’ils travaillaient sur le cas de John. Ils vérifiaient les séquences de Listeria monocytogenes et ont découvert un groupe de 130 séquences hautement apparentées soumises à la base de données entre 2016 et maintenant (tableau et figure).
Ces séquences ont montré jusqu’à 23 différences («Différences SNP») entre elles avec une moyenne de seulement 6 SNP, une différence qui est souvent observée dans les épidémies de Listeria. 97 séquences provenaient d’isolats cliniques humains aux États-Unis soumis par Pulsenet USA et 33 provenaient de pommes de terre (32) et d’une pomme (1) soumise par le service mexicain pour la santé nationale pour la sécurité alimentaire et la qualité des aliments (Senasica) avec une origine alimentaire répertoriée comme États-Unis. La distribution des soumissions de séquences par année est observée dans le tableau ci-dessous.
Tableau: Listeria Isolats of Rep Strain a soumis le référentiel de séquences publics au NCBI par année et par source.
La distribution par an a culminé entre 2017 et 2022 à partir d’un démarrage bas. Depuis 2022, il y a eu quelques infections chaque année. Jusqu’à présent, deux séquences ont été soumises en 2025. Malheureusement, la distribution d’état des isolats cliniques n’est pas fournie dans la base de données. Le CDC ou la Food and Drug Administration (FDA) n’a rien mentionné sur les épidémies ou les enquêtes sur les épidémies liées à ce représentant de la déformation sur leurs sites Web, il n’est donc pas clair s’ils l’ont jamais étudié pendant l’une des années de pointe ou au cours de la période de temps. Ceci est étrange, car le nombre total de cas est élevé et 32 des séquences proviennent d’une source de nourriture potentielle. Il s’agit certainement d’une épidémie de longue durée potentielle qui devrait être étudiée.
Les ressources du CDC et de la FDA, en particulier affectant les activités internationales, ont été considérablement réduites cette année. Bien que l’administration suggère que ces coupes traitent des inefficacités sans compromettre les fonctions de base, les scientifiques de la sécurité alimentaire contestent cette affirmation. L’enquête sur le cluster avec ce représentant des représentants pourrait fournir des indices importants pour régler ce litige testant les capacités des agences dans l’enquête et la gestion des épidémies nationales et internationales, soulignant l’importance de maintenir des programmes de sécurité alimentaire robustes.
Bonjour, FDA, CDC et State of Texas?
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