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Microbiologie

Santé

Des scientifiques cartographient le microbiote intestinal associé à la maladie coronarienne

by Sophie Martin
written by Sophie Martin

Publié le 7 novembre 2025 à 00h28. Une nouvelle étude révèle un lien complexe entre la composition du microbiote intestinal et la coronaropathie, ouvrant la voie à des stratégies de prévention et de traitement personnalisées.

  • Près de 20 millions de personnes meurent chaque année dans le monde des suites de maladies cardiovasculaires.
  • Des chercheurs ont identifié 15 espèces bactériennes associées à la coronaropathie, ainsi que des mécanismes métaboliques impliqués dans sa progression.
  • L’étude suggère que certaines bactéries considérées comme bénéfiques pourraient, dans certaines conditions, contribuer au développement de la maladie.

La coronaropathie, première cause de décès à l’échelle mondiale, est influencée par des facteurs génétiques et environnementaux. Cependant, le rôle du microbiote intestinal dans le développement et la progression de cette maladie est de plus en plus reconnu par la communauté scientifique. Une équipe de chercheurs de Séoul a récemment mené une étude approfondie sur les liens entre les microbes présents dans l’intestin et cette pathologie cardiaque.

L’étude, publiée dans la revue mSystèmes, a consisté à comparer les échantillons fécaux de 14 personnes atteintes de coronaropathie à ceux de 28 individus en bonne santé. Grâce au séquençage métagénomique – une technique permettant d’analyser l’ensemble du matériel génétique présent dans un échantillon – les chercheurs ont pu identifier 15 espèces bactériennes associées à la maladie et comprendre les voies biologiques impliquées.

« Notre cartographie métagénomique à haute résolution révèle un changement fonctionnel spectaculaire vers l’inflammation et un déséquilibre métabolique, une perte de producteurs protecteurs d’acides gras à chaîne courte, tels que Faecalibacterium prausnitzii, et une suractivation de voies, telles que le cycle de l’urée, liée à la gravité de la maladie. »

Han-Na Kim, Ph.D., génomiciste, Samsung Advanced Institute for Health Sciences and Technology, Université Sungkyunkwan

Les résultats de l’étude mettent en évidence la complexité des interactions entre le microbiote intestinal et le cœur. Les chercheurs ont notamment observé que certaines bactéries, généralement considérées comme bénéfiques pour la santé, comme Akkermansia muciniphila et F. prausnitzii, pouvaient avoir des rôles différents selon qu’elles proviennent d’un intestin sain ou malade. Cette découverte suggère que le contexte intestinal joue un rôle crucial dans la fonction de ces microbes.

L’analyse a également révélé des variations inattendues dans la présence de certaines espèces bactériennes. Par exemple, des études antérieures avaient montré une diminution des niveaux de certaines espèces de Lachnospiracées chez les patients atteints de coronaropathie, mais la nouvelle étude a constaté une augmentation d’autres types de ces bactéries. Han-Na Kim compare cette situation à celle du Dr Jekyll et de M. Hyde, soulignant la nécessité de mieux comprendre les différentes souches bactériennes et leurs effets respectifs : « La grande question sans réponse est désormais de savoir quelles variétés sont les guérisseurs et lesquelles sont les fauteurs de troubles. »

Les prochaines étapes de la recherche consisteront à intégrer les données microbiologiques avec les informations génétiques et métabolomiques des patients afin de cartographier plus précisément les mécanismes causaux des maladies cardiaques. L’objectif ultime est de développer des interventions personnalisées, basées sur une meilleure compréhension du rôle du microbiote intestinal, pour prévenir et traiter les maladies cardiovasculaires. La prévention, selon Han-Na Kim, représente la voie la plus prometteuse pour réduire le fardeau mondial de ces maladies, notamment par le biais de dépistages basés sur l’analyse des selles ou d’interventions nutritionnelles visant à restaurer l’équilibre du microbiote.

Source:

Société américaine de microbiologie

Référence du journal :

Lee, S., et al. (2025). Les génomes assemblés par métagénome révèlent des signatures microbiennes et des voies métaboliques liées à la maladie coronarienne. mSystèmes. DOI : 10.1128/msystems.00954-25. https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00954-25

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Santé

Un professeur de Scripps Research remporte une subvention de 3,2 millions de dollars pour percer les mystères du diabète de type 1

by Sophie Martin
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Publié le 29 octobre 2025 20h09. Une équipe de chercheurs de Scripps Research a reçu une subvention de 3,2 millions de dollars (environ 2,9 millions d’euros) pour étudier les mécanismes du diabète de type 1 et identifier de nouvelles pistes thérapeutiques pour prévenir ou inverser cette maladie auto-immune.

  • Le diabète de type 1, qui touche environ 1,6 million d’Américains, est une maladie auto-immune où le système immunitaire attaque les cellules productrices d’insuline.
  • Les recherches se concentrent sur le rôle des cellules fibroblastiques associées aux vaisseaux (VAF), qui agissent comme des protecteurs du pancréas, et sur la manière dont leur dysfonctionnement peut déclencher la maladie.
  • La subvention permettra d’approfondir la compréhension de l’inflammation et de son impact sur le pancréas, ouvrant potentiellement la voie à de nouvelles stratégies de traitement.

Luc Teyton, professeur au département d’immunologie et de microbiologie de Scripps Research, est à la tête de ce projet ambitieux. Cette recherche bénéficie d’une subvention sur cinq ans de l’Institut national du diabète et des maladies digestives et rénales (NIDDK). Les scientifiques espèrent ainsi percer les mystères du diabète de type 1, une maladie qui a un impact profond sur la vie des patients et de leurs familles.

Le diabète de type 1 est une maladie auto-immune complexe. Dans ce type de pathologie, le système immunitaire, censé défendre l’organisme contre les agressions extérieures, se retourne contre ses propres cellules. Dans le cas du diabète de type 1, ce sont les cellules bêta du pancréas, responsables de la production d’insuline, qui sont attaquées. L’insuline est une hormone essentielle qui permet de réguler le taux de glucose dans le sang. Sa carence entraîne une hyperglycémie, source de complications graves à long terme.

Les recherches du professeur Teyton, menées en collaboration avec Joseph Jardine, professeur adjoint, se concentrent sur un acteur insoupçonné de cette maladie : les cellules fibroblastiques associées aux vaisseaux (VAF). Ces cellules, bien que rares, jouent un rôle crucial dans le maintien de l’équilibre immunitaire au sein du pancréas. Elles agissent comme des “gardiens de la paix moléculaires”, protégeant les cellules productrices d’insuline des attaques du système immunitaire.

« Le diabète de type 1 a un impact significatif sur la vie des patients et de leurs familles, et malgré des décennies d’efforts pour le comprendre, le fonctionnement interne de la maladie reste encore un mystère. La découverte des VAF n’est que la pointe de l’iceberg. Dans la prochaine phase de notre recherche, nous utiliserons ce financement pour explorer davantage comment nous pourrions renforcer ces cellules face à l’inflammation – potentiellement trouver des moyens de guérir. »

Luc Teyton, professeur, département d’immunologie et microbiologie, Scripps Research

Les premières études menées par l’équipe de Teyton suggèrent que le diabète de type 1 pourrait se développer lorsque les VAF sont dépassées par l’inflammation, perdant ainsi leur capacité à contrôler le système immunitaire. Cela conduirait alors à la destruction des cellules productrices d’insuline et à l’apparition de la maladie.

Cette hypothèse est étayée par une découverte récente, publiée en septembre 2025 dans la revue Cell Reports. Les chercheurs ont observé que les VAF, présentes autour des régions productrices d’insuline du pancréas, présentent des antigènes – des fragments de protéines – au système immunitaire. Or, la présentation d’antigènes est normalement réservée aux cellules immunitaires spécialisées.

Les VAF expriment également une molécule appelée PD-L1, qui envoie des signaux inhibiteurs au système immunitaire, lui indiquant de ne pas attaquer. Cet équilibre délicat entre la présentation d’antigènes et l’inhibition immunitaire permet de maintenir un environnement protecteur au sein du pancréas. Cependant, en cas d’inflammation persistante, les VAF augmentent considérablement leur présentation d’antigènes, tandis que leurs signaux inhibiteurs restent constants. Ce déséquilibre pourrait déclencher une réaction auto-immune et la destruction des cellules productrices d’insuline.

Cette nouvelle perspective remet en question les idées reçues sur le déclenchement du diabète de type 1. Jusqu’à présent, on pensait que la maladie débutait lorsque des cellules immunitaires infiltraient les îlots pancréatiques et les attaquaient directement. Or, l’équipe de Teyton a constaté que les cellules immunitaires se regroupent plutôt à l’extérieur des îlots, et que les VAF se situent à la frontière entre les îlots et les vaisseaux sanguins.

« Nous avons cherché au mauvais endroit », explique le professeur Teyton. « Pendant des années, nous avons supposé que le diabète de type 1 commençait à l’intérieur des îlots pancréatiques. Mais nos recherches suggèrent que l’action se produit en réalité à l’extérieur, au niveau de cellules qui ne devraient pas présenter d’antigènes pancréatiques au système immunitaire. »

La nouvelle subvention du NIDDK permettra à l’équipe de Teyton d’approfondir ces découvertes. Les chercheurs réaliseront une analyse complète de toutes les cellules présentatrices d’antigènes dans les îlots pancréatiques, tant chez les individus sains que chez ceux atteints de diabète de type 1. Ils étudieront également les mécanismes qui régulent la présentation d’antigènes par les VAF et l’impact de l’inflammation sur leur fonctionnement. Enfin, ils exploreront le rôle potentiel de la communication entre l’intestin et le pancréas dans le déclenchement de l’inflammation et le développement du diabète de type 1.

Cette subvention comprendra les efforts de recherche décrits dans la subvention #1UG3DK142188-01 de l’Institut national du diabète et des maladies digestives et rénales (NIDDK), qui emploiera des modèles pour étudier l’initiation et la progression du diabète de type 1.

Source:

Institut de recherche Scripps

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Santé

La découverte neuve de biofilm pourrait ouvrir la voie à l’ébranlement de Pseudomonas résistant aux antibiotiques

by Sophie Martin
written by Sophie Martin

Publié le 29 octobre 2025 04:52:00. Des chercheurs de l’Université de Californie à Los Angeles (UCLA) ont mis en lumière un mécanisme clé utilisé par la bactérie Pseudomonas aeruginosa pour former des biofilms, ouvrant la voie à de nouvelles stratégies pour lutter contre les infections, notamment chez les patients atteints de mucoviscidose ou de complications respiratoires sévères.

  • Pseudomonas aeruginosa, classée par l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) comme une menace majeure pour la santé humaine en raison de sa résistance aux antibiotiques, forme des biofilms particulièrement difficiles à éradiquer.
  • L’étude révèle que cette bactérie détecte et se fixe sur des sucres spécifiques laissés par d’autres bactéries de la même espèce, utilisant des pili semblables à des cheveux comme capteurs mécaniques pour évaluer la solidité de ces liaisons.
  • Ces découvertes pourraient permettre de développer des approches pour affaiblir la résistance de la bactérie aux traitements médicamenteux et même de la rendre plus vulnérable aux antibiotiques.

Pseudomonas aeruginosa est une bactérie opportuniste redoutée, capable de provoquer des infections graves, en particulier chez les personnes souffrant de mucoviscidose ou ayant besoin d’une assistance respiratoire, comme ce fut le cas pour certains patients atteints de COVID-19. Sa capacité à former des biofilms – des communautés microbiennes complexes – la rend particulièrement résistante aux antibiotiques et aux défenses immunitaires de l’organisme. L’OMS la considère d’ailleurs comme l’une des principales menaces pour la santé mondiale.

L’équipe de recherche du California NanoSystems Institute de l’UCLA (CNSI) a récemment percé un secret de cette bactérie : la manière dont elle passe de la simple exploration d’une surface à l’établissement d’une communauté organisée. Cette découverte, publiée dans la revue Natural Microbiology, pourrait bien être une étape cruciale dans la lutte contre ces infections tenaces.

L’étude a révélé que Pseudomonas aeruginosa est capable de détecter des traces de sucres spécifiques sécrétées par d’autres bactéries de son espèce. Elle utilise pour cela des protéines situées à sa surface, ainsi que des pili de type IV, des appendices filamenteux qui lui servent habituellement à se déplacer. Dans ce contexte, ces pili agissent également comme des capteurs mécaniques, évaluant la force des liaisons entre la bactérie et les sucres. Ces informations sont ensuite transformées en signaux chimiques qui activent d’autres mécanismes bactériens, notamment la production de davantage de sucres pour renforcer la formation du biofilm.

« Nous pouvons envisager de nous appuyer sur ces résultats pour influencer le comportement de la bactérie », explique William Schmidt, doctorant en bio-ingénierie à l’UCLA et co-premier auteur de l’étude. « Nous pourrions être en mesure de transformer les cellules en versions d’elles-mêmes plus sensibles aux antibiotiques et plus faciles à traiter. »

William Schmidt, doctorant, Université de Californie, Los Angeles

Jusqu’à présent, les mécanismes précis permettant aux bactéries de détecter les sucres sécrétés par leurs congénères restaient un mystère. De plus, les protéines membranaires capables de se lier à ces sucres ne semblaient pas posséder les structures nécessaires pour transmettre un signal. L’étude de l’UCLA apporte une réponse à cette énigme en soulignant le rôle essentiel de la détection mécanique par les pili.

« Cette forme de génération de signaux est inédite dans ce domaine », souligne Gerard Wong, membre du CNSI, auteur correspondant de l’étude et professeur de bio-ingénierie à l’école d’ingénierie UCLA Samueli. « On considérait les pili principalement comme des appendices permettant de se déplacer. Il s’avère qu’ils agissent également comme des capteurs qui traduisent la force en signaux chimiques au sein des bactéries, qu’ils utilisent pour identifier les sucres. Nous voyons pour la première fois comment les informations sensorielles sont codées dans les bactéries par leurs appendices. »

Les sucres libérés par les bactéries servent à la fois de guides pour les nouvelles arrivantes et de matériaux de construction pour la communauté. Au fil du temps, ils contribuent à fixer les bactéries entre elles et à former la matrice protectrice du biofilm, le rendant plus résistant aux traitements.

Pour valider leurs découvertes, les chercheurs ont créé une surface artificielle recouverte de traces de sucre synthétique, imitant les sucres produits naturellement par la bactérie. Grâce à des techniques de génie génétique et de suivi cellulaire avancées, ils ont pu confirmer le fonctionnement coordonné de la détection chimique et mécanique.

Les implications de cette recherche vont au-delà de la santé humaine. Les biofilms peuvent également encrasser les canalisations, les filtres industriels et les coques des navires, causant des problèmes importants et des coûts considérables. « Nous pouvons nous demander : ‘Est-il possible de rendre une surface invisible aux bactéries ?’ », s’interroge Wong, qui est également professeur de chimie et de biochimie ainsi que de microbiologie, d’immunologie et de génétique moléculaire à l’UCLA. « Si vous obtenez une surface qui imite suffisamment l’espace vide, dans la mesure où les bactéries perçoivent les choses, il sera peut-être possible de résoudre ce problème de biosalissure qui coûte plusieurs milliards de dollars. »

Les chercheurs prévoient d’étudier plus en détail le répertoire complet des sucres détectés par Pseudomonas aeruginosa, ainsi que l’influence de la forme des surfaces sur le comportement de la bactérie. Ils souhaitent également explorer les liens entre ces découvertes et les mécanismes de signalisation cellulaire observés dans les biofilms.

Source:

Université de Californie, Los Angeles

Référence du journal :

Schmidt, WC, et al. (2025) Pseudomonas aeruginosa detects exopolysaccharide trails using type IV pili and adhesins during biofilm development. Natural Microbiology. doi.org/10.1038/s41564-025-02087-4.

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Santé

E. coli dans la viande vendue au détail liée à des milliers d’infections urinaires

by Sophie Martin
written by Sophie Martin

Publié le 28 octobre 2025 à 08h58. Des bactéries présentes dans la viande que nous consommons quotidiennement pourraient être à l’origine de milliers d’infections urinaires, en particulier chez les populations les plus vulnérables. Une étude récente met en lumière un lien insoupçonné entre la consommation de viande et la prolifération de ces infections.

  • Près d’une infection urinaire sur cinq (18 %) en Californie du Sud serait liée à des bactéries présentes dans la viande.
  • Les communautés à faible revenu présentent un risque accru, avec un taux d’infections liées à la viande 1,6 fois plus élevé.
  • La volaille, et notamment la dinde, semble être la source la plus préoccupante de ces infections.

Les infections urinaires (IU) sont un problème de santé publique mondial, causées le plus souvent par la bactérie Escherichia coli (E. coli). Si l’on savait déjà que cette bactérie pouvait être transmise à l’homme par l’eau ou les aliments contaminés, une nouvelle étude révèle que la consommation de viande provenant d’animaux infectés pourrait être une source d’infection plus importante qu’on ne le pensait, notamment par un processus appelé transmission zoonotique.

Publiée dans mBio, cette recherche menée en Californie du Sud entre 2017 et 2021 a analysé plus de 36 000 échantillons : 12 616 isolats d’E. coli provenant de viande vendue au détail et 23 483 isolats provenant de patients atteints d’infections urinaires. L’objectif était de déterminer la proportion d’infections urinaires causées par des souches d’E. coli d’origine animale.

L’étude a révélé que la contamination par E. coli était particulièrement élevée dans la dinde (82 %), mais également significative dans le bœuf, le poulet et le porc (entre 47 % et 58 %). Un lien clair a été établi entre les zones à faible revenu et des taux de contamination plus élevés : pour chaque augmentation de 10 % du taux de pauvreté d’une zone, la contamination de la viande augmentait de 12 %. Les produits de viande moins chers étaient également plus susceptibles d’être contaminés, suggérant que des pratiques de manipulation ou de stockage inadéquates pourraient jouer un rôle.

Les chercheurs ont également observé des différences selon l’âge et le sexe. Les hommes plus âgés (âge médian de 73 ans) étaient plus susceptibles de souffrir d’infections d’origine zoonotique que les femmes, tandis que les femmes étaient plus souvent touchées par les souches ExPEC (souches d’E. coli extra-intestinales pathogènes) d’origine animale (20 % contre 8,5 % chez les hommes).

L’analyse génomique a permis d’identifier des marqueurs spécifiques permettant de distinguer les souches d’E. coli provenant de la viande de celles présentes chez l’homme. Les éléments génétiques mobiles (MGE) ont joué un rôle clé dans cette distinction. Par exemple, les isolats de poulet et de dinde contenaient fréquemment les éléments M1, M2, M4 et M5, tandis que les isolats d’infections urinaires étaient plus susceptibles de contenir les éléments H2, H3 et H6.

En conclusion, l’étude estime que près d’une infection urinaire sur cinq (18 %) en Californie du Sud est liée à des souches ExPEC provenant d’animaux destinés à l’alimentation. Ce chiffre grimpe à 21,5 % dans les quartiers défavorisés, ce qui représente un risque 1,6 fois plus élevé. Les souches particulièrement virulentes des phylogroupes B2 et D, isolées de la viande, semblent jouer un rôle prépondérant dans ces infections.

Concernant la résistance aux antimicrobiens, les souches zoonotiques présentaient des niveaux intermédiaires entre les isolats cliniques et ceux provenant de la viande. Elles étaient moins susceptibles d’être multirésistantes que les souches non zoonotiques, mais ne différaient pas significativement des isolats de viande. Cependant, les chercheurs ont noté une diminution de la résistance à la gentamicine, potentiellement liée à la réduction de l’utilisation d’antibiotiques chez le bétail, notamment grâce à des politiques telles que la loi 27 du Sénat californien.

« Ces résultats soulignent la contribution de l’ExPEC zoonotique au fardeau des infections urinaires en Californie du Sud et la nécessité d’interventions ciblées pour réduire le risque dans les communautés vulnérables. »

Les auteurs de l’étude soulignent la nécessité de renforcer les mesures de sécurité alimentaire, en particulier concernant la volaille, afin de réduire la prévalence de ces souches dans l’approvisionnement alimentaire. Ils reconnaissent également certaines limites, notamment la difficulté de distinguer précisément les sources de viande (en particulier le bœuf) et le fait que l’étude s’est concentrée sur les infections urinaires non hospitalières, ce qui pourrait sous-estimer l’impact réel de la transmission zoonotique.

Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour évaluer l’impact clinique de la réduction de l’utilisation d’antimicrobiens chez les animaux destinés à l’alimentation. En attendant, il est recommandé aux personnes à risque (personnes immunodéprimées, personnes âgées) de faire preuve de prudence lors de la manipulation de la viande crue, en respectant scrupuleusement les règles d’hygiène et en assurant une cuisson complète avant consommation.

*Avis important : mBio publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme définitifs, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ni être traités comme des informations établies.

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Santé

Virus du Nil occidental détecté à Alvin | Nouvelles

by Sophie Martin
written by Sophie Martin

Publié le 24 octobre 2025 à 15h25. La présence du virus du Nil occidental (VNO) a été détectée chez des moustiques prélevés à Alvin, au Texas, incitant les autorités locales à lancer un programme de pulvérisation pour limiter la propagation de la maladie.

  • Des moustiques de l’espèce Culex quinquefasciatus, communément appelés moustiques domestiques du sud, ont été testés positifs pour le VNO.
  • Un programme de pulvérisation de trois nuits est prévu, avec deux interventions par nuit, pour réduire les populations de moustiques.
  • Les habitants sont invités à éliminer les sources d’eau stagnante autour de leurs domiciles pour limiter la reproduction des moustiques.

Le département des services de santé de l’État du Texas a confirmé la présence du virus du Nil occidental dans des moustiques collectés le 14 octobre 2025 à proximité de FM 517 et Legacy Blvd. à Alvin. Cette découverte déclenche une réponse rapide des autorités sanitaires locales.

Pour contrer la prolifération des moustiques porteurs du virus, le comté de Brazoria met en œuvre son protocole de lutte anti-moustiques. Ce protocole prévoit des pulvérisations nocturnes pendant trois nuits consécutives, avec deux passages des camions pulvérisateurs chaque soir. L’objectif est de diminuer significativement le nombre de moustiques adultes et de réduire ainsi le risque de transmission du VNO à la population.

Les moustiques identifiés comme porteurs du virus appartiennent à l’espèce Culex quinquefasciatus, particulièrement prolifique dans les zones où l’eau stagnante est présente. Ces moustiques se reproduisent dans de petites quantités d’eau – pots de fleurs, gouttières, pneus usagés, bains d’oiseaux – mais aussi dans des environnements plus vastes comme les étangs, les piscines non entretenues ou les fossés.

Le district de lutte contre les moustiques du comté de Brazoria insiste sur l’importance de l’élimination des sources d’eau stagnante comme moyen de prévention le plus efficace. Les habitants sont encouragés à inspecter régulièrement leurs propriétés et à vider tout récipient susceptible de retenir l’eau.

Après le traitement, des pièges supplémentaires seront installés dans la zone concernée pour surveiller l’activité des moustiques et vérifier l’efficacité des mesures prises. Les résultats de cette surveillance permettront d’ajuster les stratégies de lutte anti-moustiques si nécessaire.

Le district de lutte contre les moustiques du comté de Brazoria, créé en tant que district de santé publique dédié à la lutte contre les parasites et les vecteurs de maladies, utilise des méthodes de pulvérisation terrestres et aériennes pour traiter les zones à risque. Il collecte également des moustiques à l’aide de pièges lumineux et gravides pour les identifier et les analyser en laboratoire.

Les programmes de pulvérisation quotidiens sont consultables sur le site web du comté de Brazoria. Pour plus d’informations sur la prévention des moustiques, le guide du CDC sur la lutte contre les moustiques à la maison est une ressource utile. Des dépliants et du matériel pédagogique sont également disponibles auprès du district de lutte contre les moustiques du comté de Brazoria et de la ville d’Alvin.

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