Publié le 3 décembre 2025 à 10h55. Une étude récente révèle que la composition du microbiote pulmonaire des patients atteints de pneumonie communautaire sévère pourrait être un indicateur précoce de leur pronostic vital, ouvrant la voie à de nouvelles stratégies de prise en charge.
- L’étude a identifié des différences significatives dans la diversité et la composition du microbiote pulmonaire entre les patients décédés et ceux ayant survécu.
- Une diminution de la diversité du microbiote pulmonaire est associée à un risque accru de mortalité.
- Certaines espèces bactériennes spécifiques semblent corrélées à l’inflammation et à la réponse immunitaire, offrant des pistes pour de futurs traitements.
La pneumonie communautaire sévère (PCS) est une infection pulmonaire potentiellement mortelle, caractérisée par une inflammation importante et nécessitant souvent des soins intensifs. Les taux de prévalence et de mortalité restent élevés, soulignant la nécessité d’améliorer les outils de diagnostic et de pronostic.
Des recherches récentes mettent en évidence le rôle crucial de l’axe intestin-poumon, l’interaction complexe entre les microbiotes présents dans ces deux organes, dans la régulation de la santé et de la réponse immunitaire. Une perturbation de cet équilibre, appelée dysbiose, peut aggraver la PCS et affecter l’efficacité des traitements.
Une équipe de chercheurs a mené une étude prospective auprès de 50 patients atteints de PCS hospitalisés à l’hôpital provincial affilié à l’université de Fuzhou, en Chine, entre janvier 2024 et janvier 2025. L’objectif était d’identifier des marqueurs microbiens prédictifs de l’évolution clinique.
Les participants ont été répartis en deux groupes : un groupe de survivants (82 %) et un groupe de décès (18 %). Des échantillons de liquide de lavage broncho-alvéolaire (LBA), de selles et d’expectorations ont été prélevés et analysés pour déterminer la composition de leur microbiote.
Les résultats ont révélé que la diversité du microbiote pulmonaire était significativement plus faible chez les patients décédés que chez ceux ayant survécu. L’analyse détaillée a mis en évidence une abondance accrue de certaines espèces bactériennes, comme celles des phyla Actinomycota, Bacteroidota et Campylobactéries, chez les survivants. Une abondance relative plus élevée de Streptocoque a également été observée dans ce groupe.
En revanche, le microbiote intestinal ne présentait pas de différences significatives entre les deux groupes. Cependant, une analyse plus approfondie a révélé une diminution globale de la quantité de microbiote bactérien, tant pulmonaire qu’intestinal, chez les patients décédés.
Des analyses statistiques avancées, notamment l’analyse discriminante linéaire de l’effet de la taille (LEfSe), ont permis d’identifier des communautés bactériennes spécifiques associées à la survie ou au décès. Par exemple, le microbiote respiratoire des survivants contenait des espèces des genres Micrococcus, Corynebacterium et Bacteroides. À l’inverse, le groupe des décès présentait une prédominance de Hahellaceae et Gemminicoccaceae.
Les chercheurs ont également observé des corrélations entre la composition du microbiote et certains paramètres cliniques. Par exemple, les abondances d’Astéroleplasma et de Campylobactérie dans les poumons étaient positivement corrélées au nombre de neutrophiles, un type de globules blancs impliqué dans la réponse inflammatoire. L’abondance d’Acinétobactérie était corrélée à des niveaux élevés de procalcitonine (PCT) et de protéine C-réactive (CRP), des biomarqueurs de l’inflammation.
Ces résultats suggèrent que la composition du microbiote pulmonaire pourrait servir de biomarqueur prédictif de la gravité de la PCS et du risque de décès. Cependant, les auteurs soulignent que l’étude présente des limites, notamment sa conception transversale qui ne permet pas d’établir des relations de cause à effet. Des recherches supplémentaires, incluant des études longitudinales et des investigations mécanistiques, sont nécessaires pour mieux comprendre le rôle de l’axe intestin-poumon dans la PCS et développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.
Étude originale publiée dans Frontières de la microbiologie.