Publié le 17 janvier 2026. Des chercheurs de l’université Johns Hopkins ont mis à disposition un atlas en ligne gratuit, fruit de l’analyse approfondie des réponses immunitaires chez des patients atteints d’un cancer du pancréas, afin d’accélérer le développement de nouvelles thérapies.
- Un atlas interactif, accessible en ligne, regroupe des données de cytométrie de masse provenant de 64 patients participant à des essais cliniques sur le cancer du pancréas.
- Cette ressource permet d’identifier des signatures immunitaires spécifiques liées à différentes immunothérapies et d’étudier l’évolution de ces réponses au fil du temps.
- Une nouvelle étude clinique de phase II, menée en parallèle, suggère que les approches vaccinales peuvent stimuler des lymphocytes T capables d’infiltrer les tumeurs.
Le cancer du pancréas reste une maladie particulièrement agressive, avec un taux de survie à cinq ans de seulement 13 % selon le réseau Pancreatic Cancer Action Network. Face à ce défi, des chercheurs de l’université Johns Hopkins ont décidé de partager une ressource précieuse avec la communauté scientifique : un atlas complet des réponses immunitaires observées chez des patients atteints de cette forme de cancer.
Cet atlas, disponible gratuitement en ligne via SciServer (sciserver.org/datasets/biomed/cytof_atlas), contient les données de cytométrie de masse – l’analyse de marqueurs présents sur les cellules immunitaires – issues d’échantillons sanguins de 64 patients. Ces patients ont participé à trois essais cliniques évaluant l’efficacité de deux vaccins contre le cancer du pancréas et de deux inhibiteurs de points de contrôle immunitaire, utilisés en différentes combinaisons.
« Nous disposons d’une plateforme de profilage immunitaire basée sur l’analyse de plus de 40 marqueurs protéiques, ce qui nous permet de mieux comprendre les réactions du système immunitaire », explique le Dr Won Jin Ho, professeur agrégé d’oncologie à la faculté de médecine de l’université Johns Hopkins et directeur associé du Convergence Institute du Johns Hopkins Kimmel Cancer Center. « Nous étudions également les patients avant et après le traitement, afin de suivre l’évolution de ces réponses et de déterminer comment les différentes thérapies modifient le système immunitaire. »
Une étude décrivant l’atlas a été publiée dans le numéro du 12 janvier de la revue Recherche en immunologie du cancer, une publication de l’Association américaine pour la recherche sur le cancer. L’interface utilisateur conviviale, développée en collaboration avec l’Institute for Data Intensive Engineering and Science de Johns Hopkins, facilite la comparaison des différents types de cellules et des niveaux d’expression des marqueurs. Les chercheurs prévoient d’enrichir l’atlas avec des données provenant de l’analyse des tissus tumoraux.
« La gravité du cancer du pancréas nous a motivés à rendre cette ressource accessible au plus grand nombre », souligne le Dr Ho. « Notre équipe a mené de nombreuses recherches en immunothérapie, avec des essais de phase précoce sur des groupes de patients relativement restreints. Ces essais, bien que préliminaires, ont été très instructifs, même si les résultats cliniques n’ont pas toujours été à la hauteur de nos attentes. »
Parallèlement à la publication de l’atlas, les chercheurs ont également présenté les résultats d’une nouvelle étude de phase II, portant sur 57 patients atteints d’un cancer du pancréas métastatique dont la maladie avait progressé malgré une chimiothérapie. L’essai, dirigé par les Drs Dung Le et Katie Bever, a comparé deux groupes de patients : l’un recevant le vaccin CRS-207 combiné aux immunothérapies anti-PD1 nivolumab et anti-CTLA4 ipilimumab, avec ou sans le vaccin GVAX, pendant six cycles de 21 jours.
Bien que les taux de réponse n’aient pas été significativement différents entre les deux groupes, des analyses immunologiques approfondies, codirigées par le Dr Amanda Huff, ont révélé que les schémas thérapeutiques à base de vaccins pouvaient induire la formation de clones de lymphocytes T spécifiques de l’antigène mésothéline et de la mutation KRAS. Ces clones ont été observés dans les tumeurs, ce qui suggère une infiltration immunitaire accrue. « L’ajout d’anti-CTLA4 au traitement de base en immunothérapie augmente considérablement l’infiltration de cellules T expérimentées et constituera un élément clé des futures stratégies thérapeutiques », prédit le Dr Ho.
Les données brutes sur l’expression des protéines sont disponibles sur Zenodo (doi.org/10.5281/zenodo.13937090), tandis que le code d’analyse est accessible sur GitHub (github.com/wjhlab/Immunotherapy-Atlas).
