Travaillant pour aborder les limites auxquelles sont confrontés pendant la pandémie Covid-19 en raison de l’infrastructure informatique conventionnelle, le Conseil indien de recherche médicale (ICMR) a maintenant introduit son premier établissement informatique haute performance dans son établissement national de l’Institut de virologie (NIV) à Pune.
L’acquisition de la cluster informatique de pointe, nommée Nakshatra, vient peu de temps après que l’Inde a signalé une augmentation des cas Covid-19, bien que le nombre de cas actifs ait aidé légèrement au cours des deux derniers jours.
Le directeur de l’ICMR-NIV Pune, Naveen Kumar, a noté que plusieurs nouveaux agents pathogènes et variantes covide sont signalés. « Il est essentiel que nous soyons mis à niveau pour rester en avance dans l’amélioration de la capacité de recherche en santé publique », a-t-il déclaré.
Mise à niveau de la recherche génomique
Attribuant l’émergence de nouveaux agents pathogènes à une mondialisation accrue, au réchauffement climatique et à la déforestation, le Dr Kumar a déclaré que son centre avait effectué une analyse de séquence approfondie en utilisant plusieurs souches, qui prenaient des semaines.
«Maintenant, avec la mise à niveau, nous pouvons faire le même travail en 24 à 48 heures. Cela a augmenté la capacité de notre pays pour la surveillance génomique, ce qui nous aidera dans la préparation pandémique», a-t-il déclaré.
L’installation de Nakshatra permet un stockage amélioré et optimise le pipeline pour la recherche génomique, qui garantit une meilleure capacité de surveillance génomique virale et une préparation nationale pour toute future pandémie. L’installation soutient une analyse plus rapide des données génomiques complexes, permettant aux scientifiques de détecter de nouvelles menaces de maladie plus tôt, de répondre plus efficacement aux épidémies et à accélérer le vaccin contre l’IA et le développement de médicaments.
Référentiel de données central
Développé sous la mission d’infrastructure de santé de Pradhan Mantri Ayushman Bharat Handical Infrastructure (PMABHIM), l’installation constitue la pierre angulaire d’un nouveau projet, appelé High Performance Computing Next Generation Sequencing Hub.
L’installation de Pune desserra initialement cinq instituts ICMR à travers le pays, agissant comme un référentiel central pour les données de séquençage.
Sarah Cherian, chef de groupe du groupe Bioinformatics and Data Management et chercheur principal du projet, a donné un aperçu complet des capacités du cluster et de son rôle dans la recherche génomique. Elle a déclaré que le cluster informatique est adapté pour prendre en charge les flux de travail complexes de bioinformatique, y compris le séquençage de nouvelle génération, la transcriptomique, la phylogénétique, la métagénomique et la bioinformatique structurelle.
Impact de la surveillance génomique
Déjà, Niv Pune a joué un rôle clé dans la gestion de la pandémie Covid-19. Des altérations génétiques auparavant significatives du virus ont déclenché la deuxième et la troisième vague et la surveillance génomique continue et l’analyse ont contribué à la détection précoce des variantes d’intérêt et de préoccupation.
«Cela avait à son tour aidé à ouvrir la voie à la mise en œuvre de la dose de vaccination pour la vaccination pour Covid», a noté l’institut.
Publié – 19 juin 2025 09:36