Des microbes intestinaux avec des gènes de résistance font de l’auto-stop avec des voyageurs

Les voyageurs rentrant chez eux de destinations étrangères rapportent plus que des souvenirs et des souvenirs touristiques. Leurs tripes abritent peut-être de nouveaux auto-stoppeurs microbiens, certains d’entre eux portant des séquences de gènes qui les arment contre les antibiotiques.

Ces nouveaux résultats, publiés en ligne le 7 juin dans Médecine du génome, se démarquent parce que les chercheurs ont capturé le profil du microbiome fécal des voyageurs avant leur départ et immédiatement après leur retour. La comparaison avant-après est “la partie la plus nouvelle ici”, a déclaré Jonathan Eisen, PhD, professeur et microbiologiste à l’Université de Californie à Davis. Actualités médicales Medscape. Eisen n’a pas été impliqué dans l’étude. “Ils obtiennent un aperçu dans le temps de l’emplacement des pools d’organismes ou de gènes de résistance aux antimicrobiens.”

Pour ce travail, les chercheurs ont profilé des échantillons de selles de 190 personnes voyageant de leur domicile aux Pays-Bas vers des régions d’Afrique du Nord et de l’Est et d’Asie du Sud et du Sud-Est. Le temps que les visiteurs ont passé à leur destination était d’au moins une semaine et pas plus de 3 mois, et ils n’avaient pris aucun antibiotique dans les 3 mois précédant leur voyage.

Immédiatement après leur retour de leurs voyages, qui étaient pour la plupart des loisirs, les mêmes individus ont fourni un échantillon de selles supplémentaire. Les analyses de ces échantillons ont montré de nombreuses arrivées de nouveaux microbiotes ainsi que leurs hôtes humains itinérants, y compris 56 séquences de gènes associées à la résistance aux antibiotiques.

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Les gens peuvent attraper de nouveaux microbes dans leur intestin de plusieurs manières, notamment en mangeant et en buvant et en utilisant les toilettes dans les endroits qu’ils visitent. Quiconque voyage est considéré comme un “puits” pour acquérir de nouveaux compagnons microbiens, et un nouvel endroit qu’il visite en est une “source”. Dans cette étude, les voyageurs néerlandais étaient des « éviers ».

Ceux qui ont visité les mêmes destinations avaient tendance à ramasser de nouveaux microbes similaires, suggérant une spécificité de ces bactéries et de leurs gènes à des sources géographiques. Les chercheurs ont testé la capacité de certaines séquences du gène de l’auto-stop à conférer une résistance aux antibiotiques à Escherichia coli bactéries et a constaté qu’ils l’ont fait.

L’étude n’a pas examiné si ces compagnons de voyage acquis sont associés au risque de développer une maladie humaine, a déclaré l’auteur de l’étude Gautam Dantas, PhD, professeur de pathologie et d’immunologie à la Washington University School of Medicine à St. Louis, Missouri, dans une interview avec Actualités médicales Medscape. Lui et ses collègues n’ont pas non plus évalué ce qui arrive aux nouveaux résidents de l’intestin après que les voyageurs se soient installés chez eux. “Nous ne savons pas à quel point l’acquisition est transitoire”, a déclaré Dantas. “Qui sait, peut-être une semaine plus tard, la moitié de ces choses sont parties, peut-être qu’un an plus tard toutes sont parties… nous n’avons pas encore cette réponse.”

L’inquiétude concernant même la présence transitoire de nouveaux gènes de résistance dans l’intestin d’une personne est liée à la façon dont les bactéries ont tendance à échanger des séquences. Une cellule bactérienne portant un tel gène pourrait ne pas survivre longtemps, mais si elle transfère ce gène à des microbes natifs dans l’intestin d’une personne, la séquence elle-même pourrait devenir un résident permanent. À un moment donné, “la séquence pourrait éventuellement se transformer en un insecte susceptible de provoquer une maladie”, a déclaré Dantas, désarmant les effets habituels du traitement antibiotique.

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Ce résultat hypothétique d’un effet antibiotique compromis reste à démontrer, a déclaré Dantas. Il a souligné que les résultats actuels suggèrent que les voyages internationaux comportent un risque accru de faire le premier pas dans cette direction : trouver des compagnons de résistance.

Il a également souligné que les résultats sont inattendus avec les microbiomes adultes. “Notre compréhension générale est que le microbiome adulte est généralement stable, donc un changement est impressionnant”, a-t-il déclaré.

Eisen a ajouté que bien que l’échantillonnage pour les microbes et les gènes résistants soit assez complet dans certains pays, y compris les États-Unis, “nous n’avons pas beaucoup de données sur la résistance aux antimicrobiens provenant d’autres endroits”. Des études telles que celles-ci montrant comment les voyageurs peuvent être un “puits” pour ces microbes et séquences lorsqu’ils voyagent vers des “sources” soulignent la nécessité d’une surveillance mondiale, a-t-il déclaré.

“Nous savons que nous avons un problème mondial de résistance aux antimicrobiens et que le mouvement des personnes contribue à la propagation”, a déclaré Eisen. “C’est une évidence que nous avons besoin de mieux comprendre comment les gens les transportent d’un endroit à un autre, et ce travail obtient une partie de cette image.”

Génome Med. Publié en ligne le 7 juin 2021. Texte intégral

Dantas et Eisen ne signalent aucune relation financière pertinente.

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