Les tests COVID-19 actuels détectent-ils toujours Omicron ?

Bien qu’aucun cas de la nouvelle variante du coronavirus, Omicron, n’ait encore été signalé aux États-Unis, ce n’est qu’une question de temps. En fait, le Dr Anthony Fauci, conseiller médical en chef sur COVID-19 du président Biden, dit qu’il est probable que le virus soit déjà dans le pays, étant donné le nombre de voyages entre les pays alors que les restrictions pandémiques ont commencé à se lever ces derniers mois.

Même si la variante était là, les tests existants pourraient-ils dire si quelqu’un en a été infecté ? Les experts en tests disent oui et non. La majorité des tests utilisés par les laboratoires commerciaux et de santé publique peuvent détecter le SRAS-CoV-2, mais ils ne peuvent pas confirmer quelle version du virus est présente. C’est parce que les tests ciblent intentionnellement des parties du virus qui ne changent pas beaucoup. Les variantes sont désignées en fonction des différences de mutations – dans le cas d’Omicron, en particulier celles de la protéine de pointe, une partie du virus qui change fréquemment pour contourner les médicaments et les cellules immunitaires, et est donc difficile à tester. Ainsi, la majorité des tests disponibles montreront si une personne est porteuse du virus, mais il n’y a aucun moyen de dire si ce virus est Omicron.
[time-brightcove not-tgx=”true”]

Pour cela, un médecin devrait envoyer votre échantillon à un laboratoire qui pourra ensuite séquencer génétiquement pour rechercher les signatures génétiques uniques à Omicron.

Il existe un test commercial, de Thermo Fisher Scientific, qui peut effectuer les deux tests : les deux détectent la présence du virus et donnent aux testeurs une idée que ce à quoi ils ont affaire pourrait être la variante Omicron. Le test de la société cible trois parties différentes du SRAS-CoV-2 : deux régions relativement stables et la protéine de pointe plus variable. Il s’avère qu’Omicron affichera des correspondances positives sur les deux régions les plus stables, un modèle similaire à celui de la variante Alpha, mais affichera une inadéquation sur la portion de protéine de pointe.

La variante Delta, qui est désormais responsable de près de 99% des nouveaux cas dans le monde, ne partage pas cette omission et produit une correspondance trois pour trois sur les trois régions ciblées par le test PCR de Thermo Fisher. Cela signifie que, étant donné la domination de Delta, si un échantillon produit les trois correspondances, il s’agit probablement de Delta ; s’il n’y a que deux correspondances positives, il s’agit probablement d’Omicron. Pour confirmer, les chercheurs peuvent ensuite envoyer ces échantillons pour séquençage afin de rechercher définitivement le profil génétique d’Omicron.

« C’est une chance que ce modèle puisse signaler la présence d’Omicron », déclare Mark Stevenson, vice-président exécutif et directeur de l’exploitation chez Thermo Fisher. « C’est un bon système d’alerte précoce. Les clients utilisant le test de la société en Afrique du Sud ont alerté Thermo Fisher mercredi dernier qu’ils voyaient ces schémas inhabituels, avant même que les responsables de la santé du pays n’annoncent la recrudescence de nouveaux cas. Stevenson s’attend à ce que les laboratoires de santé publique en Europe et aux États-Unis utilisent désormais également le test pour rechercher les premiers cas de la variante Omicron.

Chez Qiagen, une société mondiale de tests qui effectue des tests à la fois pour les tests de diagnostic et à des fins de recherche, l’équipe a immédiatement évalué leur test par rapport aux échantillons de séquences génétiques d’Omicron téléchargés par des experts en santé publique dans la base de données publique GISAID. « Nous n’avons constaté aucune baisse de performance de nos produits », déclare le Dr Davide Manissero, directeur médical de Qiagen.

De même, l’équipe de recherche de la société de tests de diagnostic BD a effectué des tests de ses tests COVID-19 en utilisant les séquences Omicron dans GISAID. “Nous sommes convaincus que nos tests rapides d’antigène et de PCR pour COVID-19 détecteront la nouvelle variante”, a déclaré Dave Hickey, président de BD Life Sciences, dans un communiqué.

Si vous préférez vous fier aux tests à domicile disponibles en vente libre en pharmacie et pouvant donner des résultats en quelques minutes, ceux-ci sont également toujours utiles, au moins pour vous faire savoir si vous pourriez être positif. Comme la plupart des tests PCR, les kits à domicile ne peuvent pas déterminer si une personne est spécifiquement infectée par la variante Omicron, mais ils deviendront positifs pour toute personne infectée par une version du virus.