CXCL9 : la polarité des macrophages SPP1 identifie un réseau de programmes cellulaires qui contrôlent les cancers humains

Remerciements

Nous remercions tous les patients et leurs familles pour le don de tissus pour cette étude. Nous remercions les membres des laboratoires Pittet et Pai et du consortium P01-CA240239 pour leur apport critique. Nous remercions également M. Lanuti, D. Deschler, K. Emerick, D. Faden, D. Folch, J. Richmon, P. Song et M. Varvares pour avoir fourni des échantillons de tissus ; les Coordinateurs de Recherche Clinique du laboratoire Pai (K. Atkinson et L. Tsay) pour l’assistance technique ; et Y. Iwamoto pour la numérisation des images histologiques. Nous remercions également D. Migliorini pour avoir fourni les cellules THP-1 et JD Sostoa, A. Grimm et D. Dangaj pour le support technique.

Financement: Ce travail a été soutenu en partie par la subvention NIH P01-CA240239 (à MJP, SIP et TRM), la subvention NIH R01-CA218579 (à AMK et MJP), la subvention NIH R01 CA257623 (à SIP et RW), la subvention FDA R01 FD0006341 ( au SIP), la Fondation ISREC (au MJP) et Ludwig Cancer Research (au MJP). RB a été financé par une bourse Postdoc.Mobility et une bourse de retour du Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS ; P400PM_183852 et P5R5PM_203164). JH a été soutenu par une bourse de la Studienstiftung des Deutschen Volkes.

Contributions d’auteur: Conceptualisation : RB, PW, SIP, MS-F. et MJP Fourniture ou collecte de matériel d’étude : JCP, TMS, YM, M.Mer., DL et SIP Génération et analyse des données : RB, PW, M.Mes ., WR, BZ, FD, JCP, TMS, JH, DT, FB, MV, TAM, EMB, IG, ALKG, WCF, PMS, SIP, MS-F. et MJP Supervision et contribution essentielle : MK, JCP, ST, LK, GC, NH, GG, TRM, AMK, RW, SIP, MS-F. et MJP Préparation et édition du manuscrit : RB, PW, BZ, MK, TRM, AMK, RW, SIP, MS-F. , et MJP

Intérêts concurrents : MJP a été consultant pour AstraZeneca, Elstar Therapeutics, ImmuneOncia, KSQ Therapeutics, Merck, Siamab Therapeutics, Third Rock Ventures et Tidal. AMK est fondateur et actionnaire de 1CellBio, Inc. RW est cofondateur de T2 Biosystems, Lumicell, Aikili et Accure Health ; conseille Moderna, Alivio Therapeutics et Tarveda Therapeutics ; rapporte les frais personnels de ModeRNA, Tarveda Pharmaceuticals, Lumicell, Alivio Therapeutics et Accure Health; et est conseiller de ModeRNA, Lumicell et Accure Health. SIP a été consultant pour Abbvie, Astrazeneca/MedImmune, Cue Biopharma, Fusion Pharmaceuticals, MSD/Merck, Newlink Genetics, Oncolys Biopharma, Replimmune, Scopus Biopharma, Sensei Bio et Umoja Biopharma et a reçu des subventions et un soutien à la recherche d’Abbvie, Astrazeneca/MedImmune, Cue Biopharma, Merck, Sensei et Tesaro. Le conjoint de RB est un employé et actionnaire de CSL Behring, et RB a reçu des honoraires de conférencier de Janssen et est un mentoré du programme ENDEAVOUR-Breast de Daiichi Sankyo. PW a été consultant pour Merck-Serono, Novartis, Sanofi, Bayer et Genentech. WR est actuellement biologiste informatique senior chez Pfizer, Inc. NH conseille et détient des actions dans Related Sciences/Danger Bio, conseille Repertoire Immune Medicines, détient des actions dans BioNTech et reçoit un financement de Bristol Myers Squibb. GG reçoit des fonds de recherche d’IBM, Pharmacyclics et Ultima Genomics et est un inventeur sur les demandes de brevet liées à MSMuTect, MSMutSig, MSIDetect, POLYSOLVER, SignatureAnalyzer-GPU et MinimuMM-seq. GG est fondateur et consultant pour Scorpion Therapeutics et détient des actions privées dans Scorpion Therapeutics. GG a reçu une aide au voyage de Caris Life Sciences. RB, PW, RW, SIP et MJP sont répertoriés comme auteurs d’un brevet (demande provisoire n° 63/503 528) déposé par le Massachusetts General Hospital qui couvre une signature prédictive du pronostic tumoral et de l’efficacité du traitement. Les auteurs ne déclarent aucun autre intérêt concurrent.

Disponibilité des données et des matériaux : Les données produites grâce à la subvention NIH/NCI P01 CA240239 seront partagées d’une manière cohérente avec le partage de données dans le cadre de la politique de partage des données génomiques des NIH (NOT-OD-14-124). Les décomptes bruts des données d’ARNsc sont disponibles auprès de Gene Expression Omnibus avec le numéro d’accession. GSE234933. Les demandes de ressources et de réactifs doivent être adressées au MJP et au SIP