La protéase de type papaïne (PLpro) du SARS-CoV-2 joue un rôle essentiel dans le traitement des protéines virales nécessaires à la réplication. De plus, l’enzyme peut couper et inactiver certaines protéines humaines importantes pour une réponse immunitaire. Maintenant, les chercheurs rapportant dans Maladies infectieuses du SCA ont trouvé d’autres cibles de PLpro dans le protéome humain, notamment des protéines impliquées dans la fonction cardiovasculaire, la coagulation sanguine et l’inflammation, suggérant un lien entre l’inactivation de ces protéines et les symptômes du COVID-19.
Des virus comme le SARS-CoV-2 fabriquent plusieurs protéines sous la forme d’une longue “polyprotéine”. Les enzymes virales appelées protéases reconnaissent des séquences d’acides aminés spécifiques dans cette polyprotéine et les coupent pour libérer des protéines individuelles. Cependant, certaines protéines humaines contiennent également ces séquences (appelées séquences hôte-pathogène homologues, ou SSHHPS), y compris celles impliquées dans la génération de la réponse immunitaire innée, qui pourraient aider à protéger le virus de l’hôte. Patricia Legler et ses collègues voulaient identifier de manière exhaustive les protéines humaines contenant du SSHHPS, examiner leurs fonctions et voir si PLpro peut les cliver dans un tube à essai.
Les chercheurs ont développé une méthode de calcul pour rechercher dans une base de données de toutes les protéines humaines connues des séquences similaires ou identiques à celles du SARS-CoV-2 SSHHPS. L’analyse a révélé que les protéines avec l’identité de séquence la plus élevée étaient celles qui avaient des fonctions cardiovasculaires, inflammatoires, rénales, respiratoires ou liées au sang. Par exemple, deux des protéines contenant la SSHHPS étaient des myosines cardiaques, une était un anticoagulant et une autre était une protéine anti-inflammatoire. L’inactivation de ces protéines par PLpro est compatible avec les symptômes de COVID-19 de lésions cardiaques, de caillots sanguins et d’inflammation. L’équipe a confirmé que PLpro pouvait couper ces séquences protéiques in vitro. Effectuer la même analyse sur SSHHPS pour la protéase virale Zika a identifié des protéines associées au développement et aux troubles neurologiques, compatibles avec les symptômes de Zika. Ces résultats suggèrent que les symptômes et la virulence des virus peuvent être prédits directement à partir de leurs séquences génomiques, selon les chercheurs.
Les auteurs reconnaissent le financement du Bureau du secrétaire de la Marine, le financement de la science et de l’ingénierie innovantes navales et le Bureau de la recherche navale.
Source de l’histoire :
Matériel fourni par Société chimique américaine. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.
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