PredQ est un outil logiciel pour la prédiction de la liaison des peptides avec les protéines HLA -DQ2 et HLA -DQ8, associées à la sensibilité à la maladie cœliaque. Le PADQ a été conçu pour évaluer le risque de nouvelles protéines à provoquer une maladie cœliaque après la direction de l’EFSA sur l’évaluation des plantes génétiquement modifiées. La capacité prédictive de PredQ est basée sur l’utilisation de cinq modèles robustes, chacun produisant cinq résultats d’évaluation des risques correspondants. Ces modèles ont été développés en utilisant des ensembles de données contenant des données de liaison et de non-binders connus à la fois dans HLA -DQ2.5 et HLA -DQ8.1. Les modèles ont été dérivés de méthodes de calcul basées sur le ligand et basées sur la structure et validées par des ensembles de données internes internes. Seuls les modèles les plus performants ont été mis en œuvre dans Predq. Dans l’ensemble, PredQ représente un outil complet, convivial et fiable pour évaluer l’affinité de la liaison des peptides avec HLA -DQ2.5 et HLA -DQ8.1 et le potentiel des protéines testées pour déclencher la maladie cœliaque. Ici, nous proposons un projet visant à mettre à jour, à mettre à jour et à maintenance de Predq. En tant qu’auteurs de l’outil logiciel et des modèles qui le prennent en charge, nous proposons de mettre à jour les ensembles de données utilisés pour dériver et valider les modèles, ré-évaluer les modèles existants à l’aide de nouvelles données et dériver de nouveaux modèles, ainsi que pour maintenir l’outil, fournir des commentaires cohérents.
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