Publié le 14 janvier 2026 à 13h08. Une analyse complète du génome tumoral pourrait permettre d’affiner la sélection des patients atteints de cancer pour des traitements personnalisés, notamment les inhibiteurs de PARP, et d’élargir l’accès à ces thérapies.
- Le séquençage du génome entier identifie plus précisément les patients susceptibles de bénéficier de thérapies ciblées que les tests génétiques actuels.
- Un nouvel algorithme développé par des chercheurs de Weill Cornell Medicine et de NewYork-Presbyterian détecte les déficits de recombinaison homologue, un facteur clé de sensibilité aux inhibiteurs de PARP et à la chimiothérapie à base de platine.
- L’étude révèle que de nombreux cancers présentent des mutations affectant la réparation de l’ADN qui ne sont pas détectées par les tests standard axés sur les gènes BRCA1 et BRCA2.
Une nouvelle étude, publiée lundi dans la revue Médecine de la communication, ouvre la voie à une médecine de précision plus efficace dans la lutte contre le cancer. Des chercheurs de Weill Cornell Medicine et de NewYork-Presbyterian ont démontré que l’analyse de l’ensemble du génome tumoral permet d’identifier avec une plus grande précision les patients qui pourraient bénéficier de certains traitements ciblés, en particulier les inhibiteurs de PARP.
Jusqu’à présent, la sélection des patients pour ces thérapies reposait principalement sur la recherche de mutations dans les gènes BRCA1 et BRCA2, les causes les plus fréquentes de déficit de recombinaison homologue (DRH). Ce déficit, qui affecte la capacité des cellules à réparer leur ADN, rend les cellules cancéreuses particulièrement vulnérables aux inhibiteurs de PARP, des médicaments qui bloquent davantage la réparation de l’ADN et entraînent la mort des cellules tumorales. La chimiothérapie à base de platine est également plus efficace dans ces situations.
L’étude a analysé des centaines d’échantillons de tumeurs, en collaboration avec la société de biotechnologie Illumina. Les chercheurs ont développé et validé un algorithme capable de détecter le DRH. Cet algorithme a été entraîné sur 305 échantillons de tumeurs provenant de patients atteints de différents types de cancer traités à Weill Cornell et NewYork-Presbyterian, puis validé sur un ensemble indépendant de 556 cas oncologiques. Les performances de l’algorithme ont été comparées aux méthodes existantes en utilisant 212 autres échantillons de tumeurs.
Les premiers résultats sont prometteurs : le nouvel algorithme prédit plus correctement la réponse au traitement, y compris dans les cas où les méthodes standards ont donné des résultats différents par rapport à l’évolution clinique des patients. L’analyse a révélé la présence d’un déficit de réparation de l’ADN dans 21 % des tumeurs du sein, 20 % des cancers du pancréas et des voies biliaires, et 17 % des tumeurs gynécologiques. De manière significative, 24 % des cas identifiés ne présentaient pas de mutations BRCA1 ou BRCA2, soulignant la diversité des mécanismes génétiques impliqués dans le DRH.
Dans plusieurs cas, l’algorithme a corrigé des résultats faussement négatifs ou faussement positifs générés par des tests commerciaux. Les auteurs de l’étude soulignent que l’analyse complète du génome offre des avantages significatifs par rapport aux stratégies ciblées traditionnelles dans l’évaluation de ce type de défaut moléculaire. La recherche a été menée en collaboration avec la société de diagnostic médical Isabl, Inc., qui a contribué au développement de l’algorithme.
L’équipe prévoit de tester cette méthode dans le cadre d’études plus vastes afin d’évaluer son utilisation comme outil général pour guider le traitement du cancer. Le séquençage du génome entier, bien que plus coûteux que les tests génétiques traditionnels, est devenu suffisamment abordable pour être envisagé comme une approche plus complète et précise pour la médecine personnalisée.
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