Garvan s’associe à Google Cloud pour le séquençage du génome à grande échelle

Le Garvan Institute of Medical Research de Sydney s’est associé à Google Cloud pour traiter un ensemble de données d’environ 14 000 génomes afin de favoriser le diagnostic précoce de maladies génétiques rares.

Selon un communiqué de presse, Garvan a traité ce qui pourrait être le plus grand ensemble de données génomiques en Australie à ce jour en stockant les données génomiques sur Google Cloud et en tirant parti du flux de travail Terra et du système de gestion des données du Broad Institute.

POURQUOI EST-CE IMPORTANT

La collaboration entre Garvan et Google Cloud visait à résoudre de gros problèmes dans la recherche biomédicale, en particulier dans le stockage, l’analyse et le partage de données génomiques. Selon Google Cloud, cela nécessite une expertise et un investissement dans la génomique des populations.

“Nous savons que la résolution de certains des plus grands défis mondiaux ne se fait pas dans le vide”, a déclaré Alister Dias, vice-président de Google Cloud Australie et Nouvelle-Zélande. “L’infrastructure évolutive et sécurisée de Google Cloud a permis à Garvan d’analyser d’énormes quantités d’informations biomédicales à vitesse sans précédent », a-t-il déclaré.

L’ensemble de données généré par leur projet sera utilisé par le Center for Population Genomics (CPG), une coentreprise entre Garvan et le Murdoch Children’s Research Institute, pour “explorer la distribution de la variation génétique entre les populations et améliorer le diagnostic des maladies génétiques rares”. “.

LA GRANDE TENDANCE

« Des améliorations récentes et substantielles dans le paysage national de la génomique ont abouti à l’assemblage de biobanques à grande échelle avec des centaines de milliers d’échantillons d’ADN prêts pour la génomique et des données cliniques approfondies associées », a noté Sarah Kummerfeld, directrice de la science des données chez Garvan.

Pour soutenir le secteur croissant de la génomique en Australie, le gouvernement fédéral a révélé en mars qu’il investissait 28,1 millions de dollars australiens (19,9 millions de dollars) pour établir Genomics Australia, une future agence qui se concentrera sur la fourniture et l’accès à la médecine basée sur la génomique pour tous les Australiens.

Un groupe de travail au sein du ministère de la Santé concevra et établira l’agence sous la direction de Kathryn North, directrice du Murdoch Childrens Research Institute, avant qu’elle ne devienne une entité officielle du Commonwealth d’ici janvier 2024.

ENREGISTREMENT

“Pour que la génomique fournisse une meilleure prédiction, un meilleur diagnostic et un meilleur traitement des maladies pour tous les Australiens, nous avons besoin de la capacité d’analyser l’ADN humain à grande échelle. Ce projet démontre la valeur d’un modèle de cloud computing pour y parvenir”, a déclaré Daniel, directeur du CPG. Mac Arthur a commenté.