Une étude sur le microbiome intestinal fournit des indices sur le développement et la progression du mélanome

Une analyse comparative des bactéries fécales a révélé des différences distinctes entre les patients atteints de mélanome et les volontaires sains et entre les patients atteints de mélanome à un stade précoce ou avancé.

Les patients atteints de mélanome présentaient une plus grande abondance de Fusobactérie par rapport aux volontaires. Le microbiote fécal des patients atteints d’un mélanome à un stade précoce présentait un diversité alpha et une plus grande abondance de Roseburie par rapport aux échantillons obtenus auprès de patients atteints d’un mélanome à un stade avancé. De plus, les parcours fonctionnels présentaient différents degrés d’enrichissement selon les différents groupes de patients.

L’analyse n’a montré aucune relation entre le microbiote fécal et la récidive de la maladie chez les patients atteints d’un mélanome de stade III traités par immunothérapie, a rapporté Kelly C. Nelson, MD, du MD Anderson Cancer Center de l’Université du Texas à Houston, et co-auteurs de JAMA Dermatologie.

“Ces résultats suggèrent que la dysbiose intestinale pourrait être liée à la mélanogénèse et à la progression de la maladie”, concluent les auteurs. « Des recherches plus approfondies sont nécessaires pour confirmer ces résultats et déterminer si la modification du microbiome intestinal pourrait influencer le développement et la progression du mélanome. »

Les résultats relatifs au mélanome à un stade précoce ou avancé soutiennent le concept selon lequel la perte de diversité est associée à la progression de la maladie, ainsi qu’au développement de la maladie, ont observé Amrit K. Greene, MD, et Amanda M. Nelson, PhD, de Penn State. College of Medicine et Penn State Health à Hershey, Pennsylvanie, dans un éditorial d’accompagnement.

“Dans l’ensemble, [the findings] “Fournir des preuves supplémentaires que les profils bactériens intestinaux varient selon les stades du mélanome et qu’une perte de diversité est associée à un stade avancé de la maladie”, ont écrit Greene et Nelson. “Les questions incluent maintenant (1) la définition de la dysbiose intestinale et comment elle peut affecter la progression du mélanome et (2) comment ces informations peuvent bénéficier aux patients sur le plan pronostique, thérapeutique ou les deux. »

“Le microbiome intestinal est une pièce cruciale du puzzle de notre santé, de nos réponses thérapeutiques et de nos résultats”, ont-ils ajouté. “[These findings] fournissent une autre pièce de ce puzzle en identifiant les principales caractéristiques de la dysbiose intestinale chez les patients atteints de mélanome. À l’ère de la médecine de précision, la recherche commence à révéler le potentiel thérapeutique de cet écosystème complexe. »

De nombreuses études ont fourni la preuve que le microbiome intestinal peut influencer l’apparition du cancer, la progression de la maladie, la toxicité des médicaments et la réponse au traitement, ont noté les auteurs de l’étude dans leur introduction. En ce qui concerne le mélanome, des études précliniques et cliniques ont montré une association entre des microbes intestinaux spécifiques et la réponse à l’immunothérapie. Cependant, il existe des données limitées concernant la relation entre la composition du microbiome chez les patients atteints d’un mélanome localisé ou à un stade précoce ou s’il existe des différences par rapport aux individus sans mélanome.

L’immunothérapie a considérablement amélioré la survie de certains patients atteints de mélanome. Cependant, de nombreux patients ne répondent pas ou sont incapables de recevoir un traitement par inhibiteurs de points de contrôle immunitaires, poursuivent les auteurs. Les études en cours cherchent à mieux comprendre comment la modulation du microbiome intestinal pourrait optimiser la réponse immunothérapeutique.

Les auteurs ont réalisé une étude cas-témoins pour comparer le microbiote fécal – y compris sa diversité, sa composition et sa fonction – entre des volontaires sains et des patients atteints de mélanome. Ils ont également comparé les microbiomes de patients atteints d’un mélanome localisé à un stade précoce (stades 0 à II) et d’un mélanome métastatique à un stade avancé (stade III ou IV). Enfin, ils ont examiné le microbiote intestinal de base pour déterminer les associations avec les résultats chez les patients atteints d’un mélanome de stade III traités par immunothérapie.

L’étude a inclus 49 volontaires sains et 179 patients atteints de mélanome, dont 38 à un stade précoce et 141 à un stade avancé. Au sein de la cohorte du mélanome, les patients à un stade avancé et précoce ont été appariés selon un rapport 2:1 en ce qui concerne l’âge, le sexe, l’indice de masse corporelle et la race/origine ethnique. Les groupes appariés étaient comparables en ce qui concerne l’utilisation de médicaments, à l’exception des antibiotiques, qui étaient plus fréquents dans le sous-groupe à un stade avancé (43,3 % contre 10,5 %, P.<0,001).

La comparaison des caractéristiques du microbiome chez les patients atteints de mélanome et chez les volontaires a montré une plus grande diversité d’espèces (diversité alpha) dans le groupe témoin (médiane 16,7 contre 11,4, P.=0,06). Une analyse de la variabilité entre différents échantillons au sein d’un groupe (diversité bêta) ont montré que les témoins formaient des communautés distinctes ou distantes par rapport aux patients atteints de mélanome (P.<0,001).

Une analyse des différences de diversité entre les témoins et les patients a montré une plus grande abondance des phyla bactériens Actinomycetota et Firmicutes dans le groupe témoin. Le genre bactérien Fusobactérieimpliqué dans le cancer colorectal et l’inflammation intestinale, était plus abondant dans le groupe mélanome en analyse univariée (P.<0,001), mais pas après ajustement en fonction de l'utilisation de médicaments et d'autres facteurs (P.=0,09).

Les enquêteurs ont ensuite comparé les caractéristiques du microbiome entre les patients atteints d’un mélanome à un stade précoce et les patients appariés atteints d’une maladie à un stade avancé sans exposition à un traitement systémique. Les résultats ont montré une diversité alpha significativement plus élevée en association avec un stade précoce de la maladie (médiane 14,6 contre 10,8, P.=0,003). Les deux sous-groupes présentaient également des différences significatives en termes de diversité bêta (P.=0,03).

Les échantillons provenant de patients présentant une maladie à un stade précoce présentaient une plus grande abondance de Roseburie (2,4% contre 1,2%, P.<0,001), mais la différence n'était plus significative après ajustement des covariables. L'analyse fonctionnelle a montré que plusieurs voies étaient enrichies de manière différentielle dans les échantillons à un stade précoce et avancé.

Les enquêteurs ont analysé le microbiote fécal de 66 patients atteints d’un mélanome de stade III traités par traitement adjuvant. Au cours du suivi, 20 patients ont eu une récidive. Les patients présentant une récidive présentaient une diversité alpha significativement plus élevée (15,1 vs 11,4, P.=0,008), mais les patients avec et sans récidive ne différaient pas en ce qui concerne la diversité bêta. De plus, ils ne présentaient aucune différence significative en termes d’abondance de taxons bactériens spécifiques.