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Chaque jour, plus de 140 000 personnes aux États-Unis reçoivent un diagnostic de COVID-19. Mais peu importe à quel point ils sont curieux de savoir quelle variante ils combattent, aucun d’entre eux ne le saura.
Le pays est parsemé de laboratoires qui séquencent les génomes des cas de COVID-19, et le CDC suit ces résultats. Mais les règles fédérales disent que ces résultats ne sont pas autorisés à revenir aux patients ou aux médecins.
Selon les experts en santé publique et en maladies infectieuses, il est peu probable que cela change de si tôt.
“Je sais que les gens veulent savoir J’ai eu beaucoup d’amis ou de membres de ma famille qui m’ont demandé comment ils pouvaient le savoir”, déclare Aubree Gordon, PhD, spécialiste en épidémiologie à l’École de santé publique de l’Université du Michigan. “Je pense que c’est une chose intéressante à découvrir, c’est sûr. Et ce serait certainement bien de le savoir. Mais parce que ce n’est probablement pas nécessaire, il y a peu de motivation pour changer les règles.”
Étant donné que les tests utilisés n’ont pas été approuvés comme outils de diagnostic dans le cadre du programme Clinical Laboratory Improvement Amendments, qui est supervisé par les Centers for Medicare & Medicaid Services, ils ne peuvent être utilisés qu’à des fins de recherche.
En fait, les scientifiques qui effectuent le séquençage ont rarement des informations sur les patients, dit Gordon. Par exemple, le Lauring Lab de l’Université du Michigan dirigé par Adam Lauring, MD ― se concentre sur l’évolution virale et teste actuellement des variantes. Mais cela n’est pas fait pour le bien du patient ou des médecins traitant le patient.
“Les échantillons arrivent… et ils ont été anonymisés”, dit Gordon. “C’est juste à des fins de recherche. Peu d’informations sur les patients sont partagées avec les chercheurs.”
Mais pour l’instant, mis à part la pure curiosité, il n’y a aucune raison de changer cela, déclare Timothy Brewer, MD, professeur de médecine et d’épidémiologie à l’UCLA Fielding School of Public Health and of Medicine.
Bien qu’il existe des variantes émergentes y compris la nouvelle variante Mu, également connue sous le nom de B.1.621 et récemment classée comme “variante d’intérêt” ― la variante Delta représente environ 99% des cas américains.
De plus, dit Brewer, les traitements sont les mêmes pour tous les patients COVID-19, quelle que soit la variante.
“Il faudrait qu’il y ait une signification clinique pour qu’il y ait une bonne raison de donner cette information”, dit-il. “Cela signifierait que nous ferions quelque chose de différent en termes de traitement en fonction de la variante. Pour l’instant, ce n’est pas le cas.”
Il existe une faille qui permet aux laboratoires de publier des informations sur les variantes : ils peuvent développer leurs propres tests. Mais ils doivent ensuite passer par un long processus de validation qui prouve que leurs tests sont aussi efficaces que l’étalon-or, explique Mark Pandori, PhD, directeur du Nevada State Public Health Laboratory.
Mais même avec la validation, il est trop long et coûteux de séquencer un grand nombre de cas, dit-il.
“La raison pour laquelle nous ne le faisons pas régulièrement est qu’il n’y a aucun moyen de faire l’analyse génomique sur tous les éléments positifs”, explique Pandori. “C’est environ 110 dollars pour faire une séquence. Ce n’est pas comme un test PCR standard.”
Il y a une situation hypothétique qui peut justifier la publication de ces résultats, dit Brewer : si une variante émerge qui échappe aux vaccins.
“Ce serait un véritable problème de santé publique”, dit-il. “Vous voulez vous assurer qu’il n’y a pas de variantes émergentes quelque part qui échappent à l’immunité.”
Sources
CDC.
Organisation mondiale de la santé.
Aubree Gordon, PhD, spécialiste en épidémiologie, École de santé publique de l’Université du Michigan.
Timothy Brewer, MD, professeur de médecine et d’épidémiologie, UCLA Fielding School of Public Health and of Medicine.
Mark Pandori, PhD, directeur, Laboratoire de santé publique de l’État du Nevada.
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