Home SantéCaractéristiques génétiques du virus grippal A/H3N2 à Jiaxing, Chine (2019-2024) | Journal de virologie

Caractéristiques génétiques du virus grippal A/H3N2 à Jiaxing, Chine (2019-2024) | Journal de virologie

by Sophie Martin

Publié le 2025-11-04 10:20:00. Une étude menée à Jiaxing, en Chine, sur six ans (2019-2024) révèle une évolution constante du virus de la grippe A/H3N2, avec des pics épidémiques récurrents et une augmentation de la résistance aux médicaments, soulignant la nécessité d’une surveillance continue et d’une adaptation des vaccins.

  • Entre 2019 et 2024, 7 872 échantillons ont été analysés, révélant 636 cas du virus de la grippe A/H3N2 et six pics épidémiques.
  • Le taux de positivité pour ce virus a atteint un maximum de 19,22 % en 2022, contre 0 % en 2021.
  • L’analyse phylogénétique et l’étude des mutations génétiques indiquent une évolution rapide du virus et une diminution de son homologie avec les souches vaccinales actuelles.

Une analyse approfondie de l’épidémiologie du virus de la grippe A/H3N2 a été réalisée à Jiaxing, une ville de la province du Zhejiang en Chine, entre le 1er janvier 2019 et le 31 décembre 2024. Les chercheurs ont collecté et analysé 7 872 échantillons respiratoires provenant d’hôpitaux désignés, identifiant 636 cas positifs au virus A/H3N2. L’étude a permis de recenser six pics épidémiques sur cette période : deux en 2019, deux en 2022 et deux en 2023.

Les données statistiques montrent une variabilité significative du taux de positivité au fil des ans. Il a culminé à 19,22 % en 2022, reflétant une forte circulation virale, tandis qu’il est tombé à 0 % en 2021, probablement en raison des mesures de contrôle de la pandémie de Covid-19 et de l’immunité croisée. Sur les 636 virus A/H3N2 identifiés, 395 souches ont été isolées en culture cellulaire MDCK, et 117 d’entre elles ont été soumises à un séquençage complet du génome. Ces 117 souches représentaient plus de 12 % des échantillons annuels de virus A/H3N2, assurant une couverture représentative de la diversité virale sur la période étudiée.

L’analyse des titres d’hémagglutination, une mesure de la capacité du virus à agglutiner les globules rouges, a révélé une augmentation significative entre 2019 et 2024. Les titres étaient principalement de 8 à 16 entre 2019 et 2022, mais ont grimpé à 32 à 128 entre 2023 et 2024 ( Figure 2). Cette augmentation, statistiquement significative (p < 0,0001), suggère une plus grande virulence ou une adaptation du virus.

L’analyse phylogénétique du gène de l’hémagglutinine (HA), une protéine essentielle à l’entrée du virus dans les cellules hôtes, a révélé une évolution complexe. En 2019, les séquences de Jiaxing appartenaient principalement aux clades 3C.2a1b.1b et 3C.2a1b.2, partageant des similitudes avec des séquences provenant de Thaïlande, de Chine et du Brésil. Au fil des années, le virus a évolué vers d’autres clades, notamment 3C.2a1b.2a.2a.3 et 3C.2a1b.2a.2a.3a.1 en 2023 et 2024, avec des liens génétiques vers des souches circulant en Chine, au Royaume-Uni, en France, au Cameroun et aux Émirats arabes unis ( Figure 3). Les analyses des autres segments génétiques (NA, M, NP, NS, PA, PB1 et PB2) ont confirmé cette évolution.

L’étude a également examiné l’homologie des séquences virales de Jiaxing avec la souche A/Kansas/14/2017, utilisée dans la composition des vaccins contre la grippe de l’hémisphère Nord. Les résultats montrent une diminution de l’homologie entre 2019-2020 (96-97 %) et 2022-2024 (94-96 %) pour les gènes HA et NA ( Figure 4). Cette divergence suggère une réduction potentielle de l’efficacité des vaccins actuels contre les souches circulantes à Jiaxing.

Enfin, l’analyse des mutations d’acides aminés dans la protéine HA a révélé l’apparition de nombreuses substitutions, dont certaines se situent dans les épitopes antigéniques, les régions du virus reconnues par les anticorps. En 2023, un nombre particulièrement élevé de mutations (34) a été observé, dont 23 dans les épitopes antigéniques. Des mutations ont également été identifiées dans le site de liaison au récepteur (RBS) de l’HA, ce qui pourrait affecter la capacité du virus à infecter les cellules. Des mutations dans la protéine NA, impliquée dans la libération du virus des cellules infectées, ont également été détectées, suggérant un potentiel de résistance aux médicaments antiviraux.

L’estimation de l’efficacité vaccinale, basée sur un modèle mathématique, indique une efficacité variable selon les années et les souches vaccinales. Les résultats suggèrent que l’efficacité des vaccins actuels pourrait être limitée contre les souches A/H3N2 circulant à Jiaxing, en particulier en 2023 et 2024.

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