Publié le 10 octobre 2025 15h08. Des chercheurs de Weill Cornell Medicine et de l’Université d’Adélaïde ont mis au point une nouvelle technologie d’analyse génomique qui permet de mieux comprendre l’évolution des cancers et leur résistance aux traitements, en étudiant les cellules tumorales avec une précision sans précédent.
- GoT-Multi, un nouvel outil d’analyse génomique unicellulaire, permet de suivre simultanément de multiples mutations génétiques et l’activité des gènes dans les cellules cancéreuses.
- Cette technologie peut désormais analyser des échantillons de tissus conservés dans des conditions standard (formol et cire), élargissant considérablement son applicabilité.
- Les premiers résultats obtenus avec GoT-Multi ont permis de mieux comprendre la transformation d’une leucémie indolente en un lymphome agressif.
Une avancée majeure vient d’être réalisée dans le domaine de la génomique du cancer. Une équipe de chercheurs de Weill Cornell Medicine et de l’Université d’Adélaïde a développé un nouvel outil, baptisé GoT-Multi, capable de suivre l’évolution de plusieurs mutations génétiques tout en analysant l’activité des gènes au sein de cellules cancéreuses individuelles. Cette technologie de nouvelle génération représente une amélioration significative par rapport à son prédécesseur, GoT (Génotypage des Transcriptomes), développé à la fin des années 2010.
GoT, bien qu’innovant, présentait des limites en termes de détection de certaines mutations et du nombre de mutations qu’il pouvait analyser simultanément. De plus, il ne pouvait être utilisé qu’avec des échantillons de tissus frais ou congelés. GoT-Multi surmonte ces obstacles en permettant l’analyse d’échantillons de tissus conservés en formol et incorporés dans de la cire – une pratique courante dans les laboratoires d’anatomopathologie du monde entier, constituant ainsi une ressource précieuse pour la recherche.
Les chercheurs ont démontré le potentiel de GoT-Multi en l’appliquant à l’étude de la transformation de Richter, un processus par lequel une leucémie lymphoïde chronique relativement bénigne évolue vers un lymphome à grandes cellules B plus agressif. L’outil a permis de profiler des dizaines de milliers de cellules tumorales, d’identifier plus de deux douzaines de mutations génétiques différentes et de comprendre comment ces mutations influencent le comportement des cellules cancéreuses (croissance, inflammation) au cours de cette transformation.
« Cette technologie nous donne un nouveau pouvoir substantiel pour répondre à des questions importantes sur la façon dont les cancers évoluent, depuis les débuts des excroissances néoplasiques précancéreuses jusqu’à la transformation en tumeur maligne et enfin à la résistance au traitement. »
Dr Anna S. Nam, professeur adjoint de pathologie et de médecine de laboratoire, Weill Cornell Medicine
Le Dr Nam, également professeur adjoint de biologie cellulaire et du développement à l’École supérieure des sciences médicales Weill Cornell Medicine et pathologiste au NewYork-Presbyterian/Weill Cornell Medical Center, a dirigé le développement de GoT-Multi. Elle est membre de l’Institut anglais pour la médecine de précision et du Centre de cancérologie Sandra et Edward Meyer à Weill Cornell Medicine.
Le Dr Luciano Martelotto, professeur agrégé et chef d’équipe au Adelaide Center for Epigenetics, Université d’Adélaïde, était l’autre co-auteur principal de l’étude. Les chercheurs Dr Minwoo Pak et Dr Mirca Saurty-Seerunghen, du laboratoire du Dr Nam, ont également joué un rôle clé dans ce travail.
GoT et GoT-Multi sont considérés comme des outils « multi-omiques unicellulaires » car ils permettent d’analyser plusieurs niveaux d’informations à partir de cellules individuelles. Les chercheurs appliquent désormais GoT-Multi à une vaste cohorte de lymphomes résistants au traitement, ainsi qu’à l’étude du développement d’autres cancers et d’états précancéreux. Ils espèrent que les informations obtenues grâce à cette technologie permettront de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.
Ce travail a été soutenu par le financement du Burroughs Wellcome Fund Career Award for Medical Scientists, du National Institutes of Health Director’s Early Independence Award via le numéro de subvention DP5OD029619 et de l’accord de subvention standard du Commonwealth 4-F26M8TZ.
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