Publié le 18 novembre 2023 14:35:00. L’Institut européen de bioinformatique (EMBL-EBI) lance une nouvelle plateforme en ligne dédiée aux données mondiales sur la résistance aux antimicrobiens (RAM), une initiative cruciale pour mieux comprendre et combattre ce défi de santé publique croissant.
- La plateforme AMR centralise des données sur les mécanismes de résistance, les gènes impliqués et les séquences génomiques des bactéries résistantes.
- Elle vise à rendre ces informations plus accessibles aux chercheurs du monde entier, facilitant ainsi la recherche et le développement de nouvelles stratégies.
- La première version de la plateforme s’appuie sur des données fournies par l’Imperial College London.
La résistance aux antimicrobiens, ou RAM, représente une menace majeure pour la santé mondiale. L’utilisation excessive et parfois inappropriée d’antibiotiques a conduit à l’émergence de bactéries résistantes, rendant les infections plus difficiles à traiter. Pour contrer ce phénomène, une meilleure compréhension des mécanismes de résistance et un suivi précis de leur évolution sont essentiels.
C’est dans ce contexte que l’EMBL-EBI a développé le portail AMR. Cette nouvelle plateforme en ligne permettra aux chercheurs d’accéder à un ensemble de données consolidées, comprenant des informations sur les phénotypes de résistance, les gènes de résistance aux antimicrobiens et les séquences génomiques des bactéries concernées. Des métadonnées détaillées, telles que les méthodes expérimentales utilisées et l’origine des échantillons, seront également disponibles.
« Travailler avec l’EMBL-EBI pour créer le portail AMR signifie que ces données sont librement accessibles, permettant à la communauté mondiale de recherche d’explorer plus efficacement les mécanismes de résistance, de rassembler des preuves plus solides pour soutenir les décisions de santé publique et de promouvoir le développement de diagnostics plus précis. »
Leonid Chindelevitch, PhD, Imperial College de Londres
Les responsables de l’EMBL-EBI prévoient d’étendre la plateforme en encourageant davantage de groupes de recherche à contribuer à la base de données. L’objectif est de créer une ressource exhaustive et constamment mise à jour, capable de suivre l’évolution de la résistance aux antimicrobiens au fil du temps et de servir de référence pour le développement d’outils de prédiction.
« À mesure que davantage de groupes contribueront, ce portail s’étendra naturellement et deviendra une ressource de plus en plus puissante pour la communauté mondiale sur la RAM, permettant la création d’ensembles de données de référence pour les outils de prévision de la RAM et aidant à suivre les tendances de résistance au fil du temps. »
John Lees, PhD, chef de groupe à l’EMBL-EBI
Cette initiative s’inscrit dans un effort global pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens, un enjeu de santé publique majeur qui nécessite une collaboration internationale et un partage efficace des données.
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