Environ 6 % du génome de l’Homme de Neandertal de l’Altaï a été hérité d’une ancienne lignée d’animaux anatomiquement modernes. Un homme sage qui ont migré de l’Afrique vers l’Eurasie il y a plus de 250 000 ans, selon de nouvelles recherches menées par le Université de Pennsylvanie.
Les comparaisons des génomes de Néandertal avec les génomes humains anatomiquement modernes (AMH) montrent une histoire d’introgression de Néandertal à AMH résultant de croisements après la migration des AMH d’Afrique vers l’Eurasie. Tous les AMH d’Afrique non subsaharienne possèdent des régions génomiques génétiquement similaires à celles des Néandertaliens qui descendent de cette introgression. Des régions du génome présentant des similitudes avec Néandertal ont également été identifiées dans les populations d’Afrique subsaharienne, mais leurs origines restent floues. Pour mieux comprendre comment ces régions sont réparties à travers l’Afrique subsaharienne, la source de leur origine et ce que leur répartition dans le génome nous apprend sur les débuts de l’AMH et de l’évolution de Néandertal, Harris et autres. analysé un ensemble de données de séquences du génome entier à haute couverture provenant de 180 individus issus de 12 populations diverses d’Afrique subsaharienne. Crédit image : Holger Neumann / Musée Néandertalien.
“Nous avons trouvé ce reflet d’un métissage ancien où les gènes sont passés des anciens humains modernes aux Néandertaliens”, a déclaré le co-premier auteur, le Dr Alexander Platt, chercheur au Département de génétique de l’Université de Pennsylvanie.
« Ce groupe d’individus a quitté l’Afrique il y a entre 250 000 et 270 000 ans. Ils étaient en quelque sorte les cousins de tous les humains vivant aujourd’hui, et ils nous ressemblaient beaucoup plus que les Néandertaliens.
« Nous sommes arrivés à cette conclusion en comparant le génome de Néandertal avec un ensemble diversifié de génomes provenant de populations autochtones modernes d’Afrique subsaharienne. »
“Notre étude met en évidence l’importance d’inclure des populations ethniquement et géographiquement diverses dans les études sur la génétique humaine et la génomique”, a déclaré le professeur Sarah Tishkoff de l’Université de Pennsylvanie, auteur principal de l’étude.
Pour mieux comprendre l’étendue des régions d’ADN de type Néandertalien en Afrique subsaharienne et élucider leurs origines, les chercheurs ont analysé les génomes de 180 individus issus de 12 populations différentes au Cameroun, au Botswana, en Tanzanie et en Éthiopie.
Pour chaque génome, ils ont identifié des régions d’ADN de type néandertalien et recherché des preuves d’ascendance néandertalienne.
Ensuite, ils ont comparé le génome humain moderne à un génome appartenant à un Néandertalien qui vivait dans les montagnes de l’Altaï, en Sibérie, il y a environ 120 000 ans.
Pour cette comparaison, les chercheurs ont développé une nouvelle méthode statistique qui leur a permis de déterminer les origines de l’ADN de type Néandertalien dans ces populations subsahariennes modernes, qu’il s’agisse de régions dont les Néandertaliens ont hérité des humains modernes ou de régions dont les humains modernes ont hérité des Néandertaliens. puis ramené en Afrique.
Ils ont découvert que toutes les populations subsahariennes contenaient un ADN de type Néandertalien, ce qui indique que ce phénomène est répandu.
Dans la plupart des cas, cet ADN de type Néandertalien provient d’une ancienne lignée d’humains modernes qui ont transmis leur ADN aux Néandertaliens lors de leur migration de l’Afrique vers l’Eurasie il y a environ 250 000 ans.
À la suite de ce métissage entre l’homme moderne et l’homme néandertalien, environ 6 % du génome néandertalien a été hérité de l’homme moderne.
Dans certaines populations spécifiques d’Afrique subsaharienne, les chercheurs ont également trouvé des preuves d’une ascendance néandertalienne introduite dans ces populations lorsque des humains porteurs de gènes néandertaliens ont migré vers l’Afrique.
L’ascendance néandertalienne dans ces populations subsahariennes variait de 0 à 1,5 %, et les niveaux les plus élevés ont été observés chez les Amhara d’Éthiopie et les Peuls du Cameroun.
Pour tenter de comprendre si le fait de porter de l’ADN humain moderne était utile ou nocif lorsqu’il était introduit dans le génome de Néandertal, les scientifiques ont également étudié où se trouvaient ces fragments d’ADN humain moderne.
Ils ont découvert que la majeure partie de l’ADN humain moderne se trouvait dans des régions non codantes du génome de Néandertal, ce qui indique que les variantes des gènes humains modernes étaient préférentiellement perdues dans les sections codantes du génome, ce qui suggère que le fait d’avoir des gènes humains modernes dans un contexte néandertalien est préjudiciable. à la remise en forme.
Ceci est similaire à ce que l’on observe chez l’homme moderne, où la sélection naturelle a lentement supprimé les gènes néandertaliens des populations humaines modernes.
“Un allèle néandertalien pourrait donc très bien fonctionner chez les Néandertaliens, mais si vous l’insérez dans un génome humain moderne, cela pose des problèmes”, a déclaré le Dr Platt.
“Les humains modernes et les Néandertaliens se débarrassent lentement des allèles de l’autre groupe.”
“Au cours des presque 500 000 ans qui se sont écoulés entre la séparation des ancêtres des Néandertaliens et leurs ancêtres des humains modernes et la réintroduction de ces autres humains modernes dans les populations néandertaliennes, nous étions devenus des organismes si différents que, même si nous étions encore capables de nous croiser assez facilement, les hybrides n’a pas très bien fonctionné, ce qui signifie que nous étions très loin sur le chemin pour devenir une espèce distincte.
La recherche ouvre de nouvelles voies pour explorer l’évolution humaine en identifiant une référence génétique d’une population qui occupe une partie de l’arbre généalogique humain qui manquait auparavant dans les archives génomiques et fossiles.
“La découverte de cette ancienne lignée d’humains modernes est vraiment passionnante pour les recherches futures car elle nous donne une perspective différente pour regarder l’évolution humaine”, a déclaré le co-premier auteur, le Dr Daniel Harris, chercheur postdoctoral au Département de génétique de l’Université de Washington. Pennsylvanie.
“Comme nous ne disposons pas de séquences d’ADN provenant de fossiles humains modernes datant d’il y a si longtemps, l’identification de ces séquences mettra en lumière les toutes premières évolutions humaines modernes en Afrique.”
Le résultats ont été publiés dans la revue Biologie actuelle.
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Daniel N. Harris et autres. Divers génomes africains révèlent une sélection sur d’anciennes introgressions humaines modernes chez les Néandertaliens. Biologie actuelle, publié en ligne le 13 octobre 2023 ; est ce que je: 10.1016/j.cub.2023.09.066
