Une nouvelle étude de l’Université de Liverpool pourrait aider les scientifiques à atténuer la propagation future des maladies zoonotiques et animales causées par les virus existants.
Les chercheurs ont utilisé une forme d’intelligence artificielle (IA) appelée apprentissage automatique pour prédire plus de 20 000 associations inconnues entre des virus connus et des espèces de mammifères sensibles. Les résultats, publiés dans Communication Nature, pourraient être utilisées pour aider à cibler les programmes de surveillance des maladies.
Des milliers de virus sont connus pour affecter les mammifères, avec des estimations récentes indiquant que moins de 1% de la diversité virale des mammifères a été découverte à ce jour. Certains de ces virus tels que les virus de l’immunodéficience humaine et féline ont une gamme d’hôtes très étroite, tandis que d’autres tels que les virus de la rage et du Nil occidental ont des gammes d’hôtes très larges.
“La gamme d’hôtes est un prédicteur important pour savoir si un virus est zoonotique et pose donc un risque pour l’homme. Plus récemment, le SRAS-CoV-2 s’est avéré avoir une gamme d’hôtes relativement large qui peut avoir facilité sa propagation aux humains. Cependant, notre connaissance de la gamme d’hôtes de la plupart des virus reste limitée », explique la chercheuse principale, le Dr Maya Wardeh de l’Institut des sciences infectieuses, vétérinaires et écologiques de l’Université.
Pour combler cette lacune dans les connaissances, les chercheurs ont développé un nouveau cadre d’apprentissage automatique pour prédire les associations inconnues entre les virus connus et les espèces de mammifères sensibles en consolidant trois perspectives distinctes – celle de chaque virus, de chaque mammifère et du réseau les reliant, respectivement.
Leurs résultats suggèrent qu’il existe plus de cinq fois plus d’associations entre les virus zoonotiques connus et les mammifères sauvages et semi-domestiques qu’on ne le pensait auparavant. En particulier, les chauves-souris et les rongeurs, qui ont été associés à de récentes épidémies de virus émergents tels que les coronavirus et les hantavirus, étaient liés à un risque accru de virus zoonotiques.
Le modèle prédit également une multiplication par cinq des associations entre les mammifères sauvages et semi-domestiqués et les virus d’espèces domestiques économiquement importantes telles que le bétail et les animaux domestiques.
Le Dr Wardeh a déclaré: « Alors que les virus continuent de se déplacer à travers le monde, notre modèle fournit un moyen puissant d’évaluer les hôtes potentiels qu’ils n’ont pas encore rencontrés. Cette prévoyance pourrait aider à identifier et à atténuer les risques de zoonoses et de maladies animales, tels que les déversements. des réservoirs animaux aux populations humaines.
Le Dr Wardeh étend actuellement l’approche pour prédire la capacité des tiques et des insectes à transmettre des virus aux oiseaux et aux mammifères, ce qui permettra de hiérarchiser les études de compétence vectorielle en laboratoire dans le monde entier pour aider à atténuer les futures épidémies de maladies à transmission vectorielle.
Source de l’histoire :
Matériel fourni par Université de Liverpool. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.
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