Pour étudier la résistance au traitement dans le cancer de l’ovaire séreux de haut grade, les chercheurs MSK développent une nouvelle approche

Publié le 1er octobre 2025 à 15h14. Des chercheurs du Memorial Sloan Kettering Cancer Center ont mis au point une nouvelle méthode d’analyse génétique sanguine permettant de suivre l’évolution du cancer de l’ovaire, ouvrant la voie à des traitements plus personnalisés et efficaces contre cette maladie particulièrement agressive.

• Une nouvelle technique, baptisée Cloneseq-SV, permet de distinguer les différentes populations de cellules cancéreuses et de suivre leur évolution au fil du temps.
• L’étude révèle que les cellules résistantes aux traitements sont souvent présentes dès le diagnostic et peuvent proliférer lorsque les cellules sensibles sont éliminées.
• Cette approche pourrait être étendue à d’autres types de cancer caractérisés par une forte instabilité génomique.

Le cancer de l’ovaire est un défi thérapeutique majeur, en raison de sa tendance à se propager discrètement dans l’abdomen et de sa capacité à récidiver après un traitement initial réussi. Le cancer de l’ovaire séreux de haut grade (HGSOC), la forme la plus courante et la plus mortelle, est particulièrement difficile à vaincre. Une équipe du Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSK) à New York a donc entrepris de développer une méthode plus précise pour comprendre l’évolution de cette maladie et identifier de nouvelles cibles thérapeutiques.

Les résultats de cette recherche, publiés dans la prestigieuse revue Nature, pourraient révolutionner la prise en charge du HGSOC. Les chercheurs ont développé une approche appelée Cloneseq-SV, qui combine le séquençage du génome entier de cellules uniques et l’analyse des variantes structurelles de l’ADN. Cette méthode permet de suivre l’évolution des sous-populations tumorales dans le temps, en analysant des échantillons de sang prélevés avant, pendant et après le traitement.

« Les cancers ovariens séreux de haut grade contiennent un éventail diversifié de cellules, dont certaines seront sensibles à nos meilleurs traitements et d’autres seront résistantes », explique Marc Williams, PhD, chercheur postdoctoral à MSK et premier auteur de l’étude. « Les méthodes existantes ne font pas de distinction entre ces populations. Nous avons donc décidé d’en construire une qui le puisse. »

En utilisant Cloneseq-SV, les chercheurs ont pu identifier des « codes à barres » moléculaires, basés sur les variantes structurelles de l’ADN, qui leur ont permis de suivre les cellules tumorales dans la circulation sanguine. Ils ont découvert que les cellules résistantes étaient souvent présentes dès le diagnostic et qu’elles pouvaient se multiplier lorsque les cellules sensibles étaient détruites par la chimiothérapie ou la chirurgie.

L’étude a analysé les échantillons de sang de 18 patientes atteintes de HGSOC, du diagnostic à la récidive de leur cancer. Les résultats ont révélé que les cellules résistantes présentent des caractéristiques distinctes, notamment des amplifications de certains gènes (oncogènes), des anomalies chromosomiques (chromothripsis) et un doublage complet du génome. Ces caractéristiques pourraient constituer de nouvelles cibles pour le développement de traitements plus efficaces.

« Ensemble, ces résultats offrent de nouvelles opportunités pour développer des stratégies de traitement pour attaquer les vulnérabilités associées à ces fonctionnalités », précise le Dr Williams.

Dans un cas particulièrement encourageant, une patiente a présenté une réponse exceptionnelle au trastuzumab deruxtecan, un médicament ciblant l’oncogène Erbb2, et est restée en rémission pendant plusieurs années. L’analyse a révélé que sa tumeur contenait initialement un mélange de cellules avec et sans amplification de Erbb2, mais que les traitements initiaux avaient éliminé les cellules non amplifiées, laissant une population tumorale entièrement dépendante de cet oncogène, et donc sensible au trastuzumab deruxtecan.

Cette recherche a été menée en étroite collaboration entre des chercheurs en informatique, des chirurgiens, des pathologistes et des oncologues spécialisés dans les cancers gynécologiques, sous la direction de Carol Aghajanian, MD, Nadeem Abu-Rustum, MD, Lora Ellenson, MD et Britta Weigelt, PhD.

Les prochaines étapes de la recherche consistent à étudier un plus grand nombre de patientes afin d’identifier d’autres modèles qui pourraient guider les stratégies de traitement, et à collecter davantage d’échantillons tumoraux pendant les procédures de suivi pour obtenir une image plus complète de la diversité des cellules cancéreuses. Les chercheurs envisagent également d’appliquer cette approche à d’autres types de cancer présentant une instabilité génomique élevée.

Principaux points à retenir :

• Les chercheurs de MSK ont développé une nouvelle méthode de calcul – Cloneseq-SV – pour analyser l’évolution des cellules cancéreuses résistantes au traitement dans le cancer de l’ovaire séreux de haut grade (HGSOC).
• Cloneseq-SV pourrait conduire à de nouvelles approches pour identifier et cibler les sous-populations spécifiques de cellules qui provoquent les récidives de HGSOC.
• Cette méthode pourrait également être utile dans d’autres types de cancer présentant une instabilité génomique élevée.

Cette recherche a été financée en partie par le Halvorsen Center for Computational Oncology et Cycle for Survival soutenant MSK. Un financement supplémentaire a été fourni par Break Through Cancer, l’Ovarian Cancer Research Alliance (648007, 650687), les National Institutes of Health (CA281928-01, CA264028, P30-CA008748, CA269382), le National Cancer Institute (K99CA256508, P50-CA247749-01), le ministère de la Défense (W81XWH-20-1-0565), la Seidenberg Family Foundation, le programme Cancer Research UK Cancer Grand Challenges (C42358 / A27460), le Marie-Josée et Henry R. Kravis Center for Molecular Oncology et la Fondation de recherche sur le cancer du sein.

Le travail a utilisé les ressources du Groupe informatique haute performance, de la Facilité de base de la cytologie moléculaire et de l’ Opération de génomique intégrée à MSK.

Le Dr Shah a déclaré avoir reçu des financements de recherche d’AstraZeneca et de Bristol Myers Squibb, en dehors du cadre de ce travail. Plusieurs autres auteurs ont également déclaré des conflits d’intérêts ; veuillez consulter l’article du journal pour la liste complète.

Lisez l’étude : « Suivi de l’évolution clonale pendant le traitement dans le cancer de l’ovaire à l’aide d’ADN sans cellules » Nature. DOI : 10.1038 / S41586-025-09580-0