AlphaFold a changé la science. Après 5 ans, ça évolue encore

Publié le 24 décembre 2025 10:00:00. L’intelligence artificielle s’impose comme un outil puissant dans la recherche biomédicale, capable d’accélérer la découverte de traitements contre les infections résistantes aux médicaments et de décrypter les mécanismes complexes de la cellule. Une nouvelle approche qui pourrait révolutionner la médecine personnalisée et au-delà.

• L’IA, notamment grâce à des systèmes comme Co-scientist, peut générer des hypothèses scientifiques avec une rapidité inégalée, en analysant des décennies de données de recherche.
• Comprendre le fonctionnement interne de la cellule, en particulier son noyau, reste un défi majeur, mais l’IA offre des perspectives prometteuses pour la simulation cellulaire.
• La capacité à simuler des cellules de manière fiable pourrait transformer le développement de médicaments et la compréhension des maladies, ouvrant la voie à des thérapies personnalisées.

Des chercheurs de l’Imperial College travaillaient sur les “phages pirates”, des virus fascinants qui détournent d’autres virus pour infecter les bactéries. L’objectif : identifier les mécanismes qui leur permettent de s’introduire dans les bactéries. Une meilleure compréhension de ces processus pourrait déboucher sur de nouvelles stratégies pour lutter contre les infections résistantes aux antibiotiques, un enjeu de santé publique mondial majeur.

C’est là qu’intervient Co-scientist, un outil d’intelligence artificielle qui a démontré sa capacité à analyser rapidement une vaste quantité de publications scientifiques accumulées au fil des années. De manière autonome, le système a formulé une hypothèse sur les mécanismes de transfert de gènes bactériens qui correspondait aux conclusions de l’équipe de l’Imperial College, obtenues après des années de travail expérimental.

Selon les experts, l’IA permet de réduire considérablement la phase de formulation d’hypothèses, en synthétisant rapidement des informations issues de la littérature scientifique. Les chercheurs humains, quant à eux, conservent un rôle crucial dans la conception des expériences et l’interprétation des résultats, notamment en ce qui concerne leur impact sur les patients.

Pushmeet Kohli, de Google DeepMind, souligne l’importance de comprendre le fonctionnement des cellules dans leur ensemble.

« Ce qui me passionne vraiment, c’est de comprendre comment les cellules fonctionnent comme des systèmes complets – et le déchiffrement du génome est fondamental pour cela. »

Pushmeet Kohli, Google DeepMind

Il explique que l’ADN peut être considéré comme un livre de recettes, les protéines étant les ingrédients. Comprendre les différences génétiques et les changements qui se produisent dans l’ADN ouvre des perspectives extraordinaires, allant de la médecine personnalisée à la conception de nouvelles enzymes pour lutter contre le changement climatique.

La simulation d’une cellule entière reste un objectif ambitieux, mais les progrès sont constants. La première étape consiste à comprendre la structure interne de la cellule, et plus particulièrement son noyau : comment et quand chaque partie du code génétique est lue, et comment les molécules de signalisation sont produites pour assembler les protéines. Une fois le noyau exploré, il sera possible de progresser vers l’extérieur.

Si la simulation cellulaire devenait fiable, elle pourrait révolutionner la médecine et la biologie. Il serait possible de tester virtuellement des médicaments avant leur synthèse, de comprendre les mécanismes des maladies à un niveau fondamental et de concevoir des traitements adaptés à chaque patient. L’enjeu est de faire le lien entre la simulation biologique et la réalité clinique, en traduisant les prédictions informatiques en thérapies efficaces.

Cette histoire a été initialement publiée dans FILAIRE Italie et a été traduite de l’italien.