L’analyse génétique relie le RGO à la FPI

L’analyse génétique relie le RGO à la FPI

Les relations entre 22 comorbidités uniques et la fibrose pulmonaire idiopathique (IPF) ont été évaluées par une approche de randomisation mendélienne (MR) bidirectionnelle dans une étude rétrospective. Trois des comorbidités examinées semblaient causalement associées à un risque accru de FPI.

Les chercheurs ont utilisé des statistiques sommaires d’études d’association pangénomique à grande échelle (GWAS) obtenues auprès de l’IPF Genetics Consortium. Pour la réplication, ils ont utilisé les données de la Global Biobank Meta-Analysis Initiative (GBMI).

Des maladies pulmonaires ou extrapulmonaires sont régulièrement observées comme des comorbidités associées à la FPI. Bien que les essais contrôlés randomisés puissent fournir des preuves déductives solides des relations causales entre les maladies, ils sont également souvent soumis à des limites pratiques et éthiques inhérentes. L’IRM est une approche alternative qui exploite des variantes génétiques de gènes ayant une fonction connue comme moyen de déduire un effet causal d’une exposition modifiable sur la maladie et minimise les problèmes de confusion possibles dus à des facteurs environnementaux non liés et à une causalité inverse. L’IRM bidirectionnelle étend l’analyse de l’association exposition-résultat de l’IRM aux deux directions, produisant un niveau de preuve plus élevé pour la causalité, Jiahao Zhu, du Département d’épidémiologie et de statistiques sanitaires, Hangzhou, Chine, et ses collègues écrivent.

Détails de l’étude

Dans une étude publiée dans la revue Poitrine, les chercheurs rapportent la direction et les associations causales entre l’IPF et les comorbidités, telles que déterminées par l’analyse RM bidirectionnelle des statistiques récapitulatives GWAS de cinq études incluses dans l’IPF Genetics Consortium (4125 patients et 20 464 participants témoins). Pour la réplication, ils ont extrait les statistiques récapitulatives IPF GWAS des neuf biobanques du GBMI (6257 patients et 947 616 participants témoins). Tous les individus étaient d’ascendance européenne

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Les 22 comorbidités examinées pour une relation avec la FPI ont été identifiées grâce à une combinaison d’une recherche documentaire dans la base de données PubMed limitée aux articles en anglais concernant la FPI en tant qu’exposition ou résultat et ayant une statistique récapitulative complète GWAS disponible. Le nombre de patients dans ces études variait d’un minimum de 3 203 pour l’ostéoporose à un maximum de 246 363 pour le trouble dépressif majeur.

Pour estimer les relations causales, la sélection des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) pour l’IPF et chaque instrument génétique de comorbidité était basée sur une valeur de signification à l’échelle du génome (P < 5x10-8) et ont été regroupés par déséquilibre de liaison (r2 < 0,001 dans une distance d'agrégation de 10 000 ko). Les preuves issues de l'analyse associant chaque comorbidité à la FPI ont été classées comme convaincantes, suggestives ou faibles. Des études de suivi ont examiné les effets causals des variables pulmonaires et thyroïdiennes mesurées sur l'IPF et les effets de l'IPF sur les variables de pression artérielle.

Évidence convaincante

L’IRM bidirectionnelle et l’analyse de suivi ont révélé des “preuves convaincantes” de relations causales entre l’IPF et deux des 22 comorbidités évaluées. Un risque plus élevé de FPI était associé au reflux gastro-oesophagien (RGO). Il est important de noter qu’une analyse RM multivariée conditionnée pour le tabagisme a continué de montrer le lien de causalité entre le RGO et un risque plus élevé de FPI. En revanche, la responsabilité génétique de la MPOC semblait conférer un rôle protecteur, comme l’indique une diminution associée du risque de FPI. Les chercheurs suggèrent que cette relation négative pourrait être due à leur architecture génétique distincte.

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Preuve suggestive

Des “preuves suggestives” de relations sous-jacentes entre la FPI et le cancer du poumon ou les comorbidités phénotypiques de la pression artérielle ont également été trouvées dans cette étude. Les résultats de l’IRM appuient les preuves existantes selon lesquelles la FPI a un effet causal sur un risque plus élevé de cancer du poumon. En revanche, l’IPF semble avoir un effet protecteur sur les phénotypes de l’hypertension et de la PA. Cela contrastait avec la VTE : sur la base d’une analyse RM bidirectionnelle, les chercheurs suggèrent que la VTE était plus susceptible d’être une cause plutôt qu’une conséquence de la FPI.

Limites

Les principaux points forts de l’étude étaient la capacité de la conception MR à améliorer l’inférence causale, en particulier lorsque de grandes cohortes pour des enquêtes prospectives seraient intrinsèquement difficiles à obtenir. Plusieurs limitations notées incluent le fait que les estimations causales peuvent ne pas être bien appariées aux études observationnelles ou interventionnelles et qu’il y avait un faible nombre de SNP disponibles comme instruments génétiques pour certaines maladies. De plus, il y avait un biais potentiel en raison d’un certain chevauchement d’échantillons parmi les bases de données utilisées, et on ne sait pas si les résultats sont applicables à des ethnies autres que celles d’ascendance européenne.

Conclusion

Dans l’ensemble, cette étude a montré qu’une approche d’analyse RM bidirectionnelle pourrait tirer parti des informations génétiques provenant de grandes bases de données pour révéler des associations causales entre la FPI et plusieurs comorbidités différentes. Cela comprenait une relation causale apparente entre le RGO, la TEV et l’hypothyroïdie avec la FPI, selon les chercheurs. Celles-ci fournissent la base pour obtenir “une compréhension plus approfondie des voies sous-jacentes à ces diverses associations” qui peuvent avoir des “implications précieuses pour l’amélioration des stratégies de prévention et de traitement des comorbidités”.

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Les auteurs n’ont révélé aucune relation financière pertinente.

Poitrine. Publié en ligne le 2 mars 2023. Texte intégral

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