La dynamique de l’ascendance dénisovienne chez les Eurasiens au cours des 40 000 dernières années révélée

Publié le 4 novembre 2025. Une étude révolutionnaire révèle que l’ascendance dénisovienne chez les populations eurasiennes est plus complexe qu’on ne le pensait, avec des schémas de métissage régionaux distincts sur les 40 000 dernières années.

• Les premiers habitants d’Asie de l’Est, comme l’individu de Tianyuan en Chine, présentent le plus fort taux d’ascendance dénisovienne connu à ce jour (plus de 0,2 %).
• L’ascendance dénisovienne s’est diffusée en Eurasie occidentale il y a environ 12 000 ans, principalement par le biais de migrations depuis l’Asie orientale.
• Les anciens habitants de l’archipel japonais (Jomon) présentent un taux d’ascendance dénisovienne étonnamment bas, suggérant des schémas de migration et de contacts différents.

Les interactions entre les humains modernes et les Dénisoviens, un groupe d’hominidés aujourd’hui disparu, ont laissé des traces génétiques durables dans les populations actuelles. Si l’on savait que des événements de métissage avaient eu lieu, la nature précise et la chronologie de ces rencontres restaient largement obscures. Une nouvelle étude, publiée dans la revue Current Biology, apporte un éclairage inédit sur cette histoire complexe grâce à une analyse paléogénétique systématique des segments d’ADN hérités des Dénisoviens.

En compilant les données issues de génomes anciens provenant de toute l’Eurasie, les chercheurs ont pu reconstituer la dynamique de l’ascendance dénisovienne au fil du temps et de l’espace. Ils ont notamment découvert que les premiers Asiatiques de l’Est, notamment l’individu de Tianyuan (datant d’environ 40 000 ans), possédaient le plus fort taux d’ascendance dénisovienne parmi tous les individus anciens et modernes étudiés. Cependant, l’analyse des segments d’ADN partagés entre les individus suggère que cette ascendance provient d’épisodes de contact communs avec les Dénisoviens, partagés par les populations d’Asie de l’Est au fil des générations.

« Cela indique que le flux génétique provient d’une source avec moins, voire pas d’ascendance dénisovienne, ce qui a dilué l’ascendance dénisovienne des premiers Asiatiques de l’Est », explique Stéphane Peyrégne, généticien des populations et co-superviseur de l’étude.

Stéphane Peyrégne, généticien des populations

L’étude révèle également que l’ascendance dénisovienne a atteint l’Eurasie occidentale, bien qu’à un niveau plus faible, principalement à partir d’il y a environ 12 000 ans, avec la propagation de populations originaires d’Asie orientale. L’ADN dénisovien se révèle ainsi être un marqueur précieux pour retracer l’histoire des populations humaines.

Une autre découverte surprenante concerne les anciens habitants de l’archipel japonais (Jomon) et des îles Ryukyu/Okinawa, qui ont contribué à la formation du peuple japonais actuel. Ces populations présentent le taux d’ascendance dénisovienne le plus bas parmi les Asiatiques de l’Est, bien que leur ascendance dénisovienne ait la même origine que celle des populations du continent. Cela suggère que les Jomon descendent d’une lignée qui n’a pas rencontré les Dénisoviens directement, mais qui a hérité de leur ascendance par le biais de flux génétiques ultérieurs en provenance d’Asie orientale. Une autre possibilité est que cette lignée ait reçu un flux génétique limité des Dénisoviens avant de se séparer des autres populations d’Asie de l’Est, manquant ainsi des contacts ultérieurs et plus importants.

« Cela suggère que certains groupes ont emprunté des itinéraires différents au cours des premières dispersions en Asie de l’Est, ou que les Dénisoviens étaient si peu répartis que les interactions avec eux étaient rares », explique Jiaqi Yang, chercheur principal à l’Institut Max Planck d’anthropologie évolutionniste.

Jiaqi Yang, chercheur principal à l’Institut Max Planck d’anthropologie évolutionniste

Bien que les connaissances sur les origines des Jomon et des autres populations d’Asie de l’Est au Paléolithique restent limitées, ces découvertes soulignent la complexité et la diversité régionale des interactions entre les humains modernes et les Dénisoviens. De nouvelles données génomiques anciennes seront nécessaires pour affiner notre compréhension du moment et de la nature de ces rencontres.